More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6291 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6291  porin  100 
 
 		 392 aa  784    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  56.23 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  55.61 
 
 		 381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  55.12 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  53.81 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  54.17 
 
 		 381 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  55.53 
 
 		 379 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  53.56 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  51.97 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  51.97 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  51.97 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.72 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  55.04 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.72 
 
 		 379 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.72 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  54.22 
 
 		 374 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  54.55 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  50.99 
 
 		 383 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  50.49 
 
 		 383 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  51.53 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  51.23 
 
 		 384 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  50.75 
 
 		 383 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  47.67 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  49.12 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  49.37 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  47.68 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  48.76 
 
 		 380 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  48.87 
 
 		 376 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  49.37 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  49.37 
 
 		 384 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  49.37 
 
 		 384 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  49 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  49.37 
 
 		 384 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  49 
 
 		 380 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  49.12 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  49.12 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  48.87 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  45.83 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  45.83 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  45.83 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  45.83 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  45.83 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  45.83 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  45.83 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  49 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  46.5 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  48.37 
 
 		 379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  44.61 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  49.27 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  48.25 
 
 		 383 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  46.89 
 
 		 391 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  50 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  50.67 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  47.64 
 
 		 411 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  45.5 
 
 		 375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  46.9 
 
 		 377 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  45 
 
 		 375 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  45 
 
 		 375 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  47.59 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  43.9 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  47.09 
 
 		 376 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  47.09 
 
 		 376 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  47.09 
 
 		 376 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  47.09 
 
 		 376 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  45.77 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  47.34 
 
 		 374 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  45.21 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  45.21 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  47.34 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  47.34 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  44.28 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  44.04 
 
 		 403 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  44.96 
 
 		 391 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  43.58 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  43.34 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  43.7 
 
 		 471 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  46.86 
 
 		 375 aa  288  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  43.31 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.5 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  41.73 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  42.65 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  42.65 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  42.65 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.25 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  41.56 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  42.51 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  42.82 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.07 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  42.79 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  43.86 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  42.2 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  43.58 
 
 		 386 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  46.85 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  41.03 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  46.85 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  46.85 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  45.69 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  42.31 
 
 		 394 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  46.48 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  43.92 
 
 		 436 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>