More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1454 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  97.66 
 
 
384 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  97.66 
 
 
384 aa  742    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  85.94 
 
 
384 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  97.66 
 
 
384 aa  742    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  97.66 
 
 
384 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  85.94 
 
 
384 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  84.38 
 
 
384 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  87.24 
 
 
384 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
414 aa  834    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  84.38 
 
 
384 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  85.94 
 
 
384 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  97.66 
 
 
384 aa  742    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  97.66 
 
 
384 aa  742    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  97.66 
 
 
384 aa  742    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  83.59 
 
 
384 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  66.15 
 
 
383 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  63.9 
 
 
381 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  64.84 
 
 
383 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  65.3 
 
 
386 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  63.59 
 
 
385 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  63.02 
 
 
394 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  64.92 
 
 
386 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  60.2 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  62.06 
 
 
394 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  60.72 
 
 
383 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  60.1 
 
 
382 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  51.42 
 
 
383 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  53.37 
 
 
381 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.43 
 
 
379 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  49.22 
 
 
377 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.41 
 
 
383 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  52.43 
 
 
379 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.15 
 
 
383 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  52.39 
 
 
380 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.17 
 
 
379 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.17 
 
 
379 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.17 
 
 
379 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.92 
 
 
379 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  51.89 
 
 
380 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  52.38 
 
 
379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  52.88 
 
 
374 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 
386 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  51.16 
 
 
383 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  52.16 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  50.27 
 
 
382 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  50.51 
 
 
379 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.87 
 
 
383 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  49.36 
 
 
381 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  50.63 
 
 
381 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  51.89 
 
 
381 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  51.28 
 
 
384 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  49.25 
 
 
380 aa  335  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  49.62 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  49.62 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  49.62 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  49.62 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  49.62 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  50.88 
 
 
377 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  49.62 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  50 
 
 
377 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  49.37 
 
 
384 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  48 
 
 
380 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  46.39 
 
 
409 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  46.39 
 
 
409 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  48.97 
 
 
384 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  47.09 
 
 
436 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  50 
 
 
384 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  48.7 
 
 
389 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  48.7 
 
 
389 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  48.88 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  48.88 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  48.88 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  48.88 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  48.88 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  48.44 
 
 
389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.12 
 
 
391 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  49.88 
 
 
383 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  48.27 
 
 
436 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  49.88 
 
 
383 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  48.64 
 
 
386 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  47.96 
 
 
391 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  50.26 
 
 
363 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  46.84 
 
 
380 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  49.88 
 
 
385 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  49.63 
 
 
385 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  48 
 
 
380 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  46.65 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  49.6 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  46.65 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  46.75 
 
 
380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  47.5 
 
 
380 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  49.14 
 
 
383 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  48.16 
 
 
389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  48.58 
 
 
375 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  47.5 
 
 
380 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  50.12 
 
 
389 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  47.75 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  48.24 
 
 
383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  50.49 
 
 
389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.78 
 
 
383 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>