More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0475 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 389 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  95.12 
 
 		 389 aa  703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  80.26 
 
 		 436 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  79.74 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  79.74 
 
 		 436 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  79.74 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  79.74 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  79.74 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  79.74 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  79.49 
 
 		 386 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  77.18 
 
 		 385 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  76.92 
 
 		 385 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  76.15 
 
 		 383 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  75.26 
 
 		 389 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  76.41 
 
 		 383 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  76.41 
 
 		 383 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  75.64 
 
 		 383 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  66.25 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  71.25 
 
 		 402 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  63.66 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  55.69 
 
 		 400 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  55.95 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  53.06 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  55.89 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  53.69 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  54.19 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  56.54 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  51.45 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  50.75 
 
 		 389 aa  349  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  50.5 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  52.12 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  47.46 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  48.01 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  51.11 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  51.11 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  51.11 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  51.11 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  51.11 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  51.11 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  51.11 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50.62 
 
 		 414 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  51 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  47.9 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  50.62 
 
 		 384 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  46.65 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  51.11 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  51.11 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  51.11 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  44.91 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  45.16 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  45.12 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  45.63 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  49.75 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44.53 
 
 		 421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44.53 
 
 		 421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.53 
 
 		 397 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  47.27 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  44.39 
 
 		 379 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  49.26 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  45.96 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  44.84 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  47.88 
 
 		 381 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  45.96 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  45.96 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  47.63 
 
 		 381 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  46.06 
 
 		 396 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  46.88 
 
 		 381 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  45.55 
 
 		 378 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  45.98 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  45.98 
 
 		 383 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  49.5 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  42.64 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  43.9 
 
 		 399 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.9 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.9 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.42 
 
 		 397 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.9 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.9 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  46.17 
 
 		 398 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  44.7 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  44.7 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  46.06 
 
 		 394 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  45.98 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  45.34 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  46.23 
 
 		 384 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  43.86 
 
 		 391 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  44.69 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  47.63 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  45.45 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  45.77 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  47.41 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  47.16 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  44.19 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  45.91 
 
 		 382 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  45 
 
 		 381 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  46.15 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  46 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  45.36 
 
 		 387 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  46.29 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>