More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1699 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  94.04 
 
 		 386 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  777    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  78.24 
 
 		 385 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  72.42 
 
 		 383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  66.67 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  66.39 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  65.12 
 
 		 414 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  64.85 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  64.85 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  64.85 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  64.85 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  64.85 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  65.3 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  63.47 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  64.85 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  64.85 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  60.95 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  63.93 
 
 		 384 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  61.62 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  63.93 
 
 		 384 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  63.93 
 
 		 384 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  63.32 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  60.21 
 
 		 381 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  64.75 
 
 		 384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  62.3 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  57.89 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  55.84 
 
 		 381 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  52.59 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  48.94 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  47.03 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  49.74 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  49.74 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  49.74 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  49.74 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  49.48 
 
 		 379 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  49.32 
 
 		 380 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  45.81 
 
 		 386 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  49.32 
 
 		 382 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  48.79 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  47.69 
 
 		 383 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  49.32 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  48.95 
 
 		 381 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  47.44 
 
 		 383 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  47.93 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  48.17 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  48.71 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  47.53 
 
 		 381 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  47.53 
 
 		 381 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  46.37 
 
 		 380 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  48.67 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  47.12 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  44.18 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  44.18 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.42 
 
 		 384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  43.92 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  45.81 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  44.97 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  44.17 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44.17 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  44.17 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  44.17 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44.17 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  44.95 
 
 		 409 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  44.95 
 
 		 409 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  44.47 
 
 		 382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  44.47 
 
 		 382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  44.7 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  43.42 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  47.38 
 
 		 375 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.16 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.91 
 
 		 385 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  47.38 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  46.51 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  44.06 
 
 		 380 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  46.34 
 
 		 375 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  46.34 
 
 		 375 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  43.51 
 
 		 380 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  46.48 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  44.03 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  44.61 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.73 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  45.33 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  44.3 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  43.56 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  44.3 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.14 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.64 
 
 		 383 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  43.72 
 
 		 383 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  43.57 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  43.27 
 
 		 380 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  43.27 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  45.14 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.64 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.64 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  46.03 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  41.09 
 
 		 380 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  42.3 
 
 		 380 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  42.61 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  42.08 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  46.51 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>