More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0066 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2847  porin  88.69 
 
 		 389 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  94.52 
 
 		 383 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  90.13 
 
 		 385 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  100 
 
 		 383 aa  754    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  90.39 
 
 		 385 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  98.69 
 
 		 383 aa  744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  100 
 
 		 383 aa  754    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  82.17 
 
 		 436 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  82.17 
 
 		 386 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  82.17 
 
 		 386 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  82.17 
 
 		 386 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  82.17 
 
 		 386 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  81.91 
 
 		 436 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  82.17 
 
 		 386 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  81.91 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  76.67 
 
 		 389 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  76.67 
 
 		 389 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  68.3 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  63.07 
 
 		 395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  63.84 
 
 		 391 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  57.28 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  56.51 
 
 		 389 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  56.53 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  54.21 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  54.41 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  55.31 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  57.82 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  51.33 
 
 		 408 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  51.01 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  47.34 
 
 		 409 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  50.99 
 
 		 398 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  50.5 
 
 		 381 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  48.87 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  49.37 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.87 
 
 		 383 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  49.87 
 
 		 383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  52.44 
 
 		 352 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  48.1 
 
 		 389 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  49.88 
 
 		 414 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  45.16 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  45.16 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  45.16 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  45.16 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  45.16 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  47.07 
 
 		 386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  45.66 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  45.87 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  50.5 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  46.62 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  47.13 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  48.86 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  44.39 
 
 		 386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  48.11 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  48.24 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  45.37 
 
 		 422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  48.87 
 
 		 383 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  44.5 
 
 		 397 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  47.59 
 
 		 387 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  49.5 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  47.16 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  49.5 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  49.5 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44.25 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44.25 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  48.36 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  44.91 
 
 		 397 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  46.06 
 
 		 379 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  47.74 
 
 		 381 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  43.89 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  49.5 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.98 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  45.9 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.14 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  49.5 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.37 
 
 		 391 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  45.41 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  47.13 
 
 		 384 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  48.37 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  48.37 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  47.14 
 
 		 366 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  45.41 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  47.14 
 
 		 366 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  45.41 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  46.6 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  44.9 
 
 		 386 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  45.5 
 
 		 375 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  44.9 
 
 		 386 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  45.5 
 
 		 375 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  46.97 
 
 		 412 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  48.16 
 
 		 393 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  48.7 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  47.24 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  45.5 
 
 		 375 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>