More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3606 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3606  porin  100 
 
 		 383 aa  769    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  74.36 
 
 		 390 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  71.87 
 
 		 391 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  73.11 
 
 		 383 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  74.65 
 
 		 409 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  68.59 
 
 		 383 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  66.41 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  66.67 
 
 		 384 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  66.41 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  66.15 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  66.15 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  66.15 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  65.62 
 
 		 384 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  62.34 
 
 		 380 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  65.67 
 
 		 380 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  62.08 
 
 		 380 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  65.4 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  63.76 
 
 		 380 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  63.76 
 
 		 379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  61.3 
 
 		 380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  61.85 
 
 		 411 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.53 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  55.17 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.53 
 
 		 383 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  52.59 
 
 		 374 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.53 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  52.49 
 
 		 381 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.53 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.53 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.53 
 
 		 379 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  52.27 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  52.53 
 
 		 379 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  53.12 
 
 		 381 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  53.15 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  52.38 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  51.25 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  51.88 
 
 		 383 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  53.76 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  53.49 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.87 
 
 		 384 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  53.4 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  52.48 
 
 		 379 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  50.92 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  48.88 
 
 		 409 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  48.88 
 
 		 409 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  48.09 
 
 		 376 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.88 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  50.38 
 
 		 375 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  48.72 
 
 		 375 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  49.36 
 
 		 375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  49.36 
 
 		 375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  49.87 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  48.01 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  48.01 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  48.01 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  48.01 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  48.01 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  48.01 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  48.01 
 
 		 384 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.46 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  49.23 
 
 		 374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  49.23 
 
 		 374 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.78 
 
 		 383 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  48.97 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  48.97 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  48.97 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  48.97 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  48.97 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  48.97 
 
 		 374 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  47.09 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  47.57 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  46.12 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  46.73 
 
 		 381 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  46.07 
 
 		 384 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.92 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  48.79 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.03 
 
 		 385 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  46.17 
 
 		 384 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.42 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  45.29 
 
 		 384 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  45.29 
 
 		 384 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  45.29 
 
 		 384 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.17 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  45.91 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.25 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.95 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  48.53 
 
 		 362 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  48.53 
 
 		 362 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  48.53 
 
 		 362 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  43.65 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  45.59 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  48.93 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  44.56 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  44.12 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.36 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  48.39 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  45.81 
 
 		 407 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  48.39 
 
 		 372 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.11 
 
 		 385 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  44.12 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>