More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1679 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4216  porin  88.95 
 
 
380 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  89.21 
 
 
380 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  88.95 
 
 
379 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
380 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  88.95 
 
 
380 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  90 
 
 
380 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  88.42 
 
 
380 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  75.79 
 
 
411 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  69.09 
 
 
384 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  69.09 
 
 
384 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  68.83 
 
 
384 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  68.83 
 
 
384 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  68.31 
 
 
384 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  68.83 
 
 
384 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  68.31 
 
 
384 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  60.51 
 
 
390 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  62.08 
 
 
383 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  63.74 
 
 
383 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  59.59 
 
 
383 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  62.6 
 
 
409 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  59.85 
 
 
391 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  53.42 
 
 
383 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  52.53 
 
 
379 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.54 
 
 
383 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  51.78 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  51.78 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.52 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.89 
 
 
381 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  51.78 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.52 
 
 
379 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.52 
 
 
379 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.12 
 
 
374 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  52.27 
 
 
380 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  52.02 
 
 
380 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  50.12 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  52.23 
 
 
379 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 
383 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  51.12 
 
 
381 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.24 
 
 
383 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 
384 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.25 
 
 
381 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  50 
 
 
375 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  48.37 
 
 
383 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  49.25 
 
 
414 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  50.5 
 
 
384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  48.71 
 
 
375 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  47.94 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  47.94 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  49.37 
 
 
392 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  49.19 
 
 
375 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  48.01 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  47.62 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  48.84 
 
 
377 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  47.37 
 
 
409 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  47.37 
 
 
409 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  48.84 
 
 
377 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  47.21 
 
 
385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.15 
 
 
383 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.49 
 
 
384 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.69 
 
 
396 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  43.32 
 
 
376 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  45.91 
 
 
384 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.97 
 
 
363 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  45.91 
 
 
384 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  45.91 
 
 
384 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  44.7 
 
 
381 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  46.44 
 
 
384 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.44 
 
 
384 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  48.59 
 
 
374 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  48.59 
 
 
374 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  48.59 
 
 
374 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  45.48 
 
 
394 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  46.5 
 
 
389 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.37 
 
 
385 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.37 
 
 
385 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  48.21 
 
 
376 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  48.21 
 
 
376 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  48.21 
 
 
376 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  46.94 
 
 
383 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  48.21 
 
 
376 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  48.34 
 
 
374 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  49.74 
 
 
361 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  48.85 
 
 
362 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  48.85 
 
 
362 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  48.85 
 
 
362 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  45.53 
 
 
386 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.94 
 
 
383 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.81 
 
 
394 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  45.38 
 
 
385 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.68 
 
 
383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.68 
 
 
383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  46.17 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  48.85 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>