More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0393 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  73.51 
 
 		 382 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  61.54 
 
 		 384 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  57.29 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  57.29 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  57.03 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  54.36 
 
 		 391 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  55.38 
 
 		 382 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  55.38 
 
 		 382 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  51.8 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  51.95 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  50.89 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  51.03 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  52.42 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  49.49 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  49.87 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50.8 
 
 		 414 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  50.27 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  50.27 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  50.27 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  50.27 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  50.27 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  50.27 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  50.27 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  50.54 
 
 		 384 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  49.59 
 
 		 385 aa  345  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  46.91 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  50.27 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  50.27 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  50.27 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  47.29 
 
 		 382 aa  339  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  49.19 
 
 		 384 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  48.92 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  49.33 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  47.43 
 
 		 386 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  45.5 
 
 		 383 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  44.53 
 
 		 381 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  46.3 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.02 
 
 		 381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.65 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  46.93 
 
 		 379 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  45.55 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  45.13 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  44.1 
 
 		 381 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.08 
 
 		 375 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.37 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  43.59 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  42.53 
 
 		 375 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.11 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  44.95 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.54 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  43.01 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  42.56 
 
 		 375 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  42.56 
 
 		 375 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.96 
 
 		 379 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  43.67 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  43.41 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  43.41 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  40.93 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  43.41 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.33 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  43.15 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.83 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  44.07 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  42.27 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  44.17 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  42.25 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  43.48 
 
 		 395 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  40.85 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  43.36 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  43.07 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  43.07 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  43.07 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  43.07 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  43.07 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1943  hypothetical protein  63.85 
 
 		 209 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366238  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0960  hypothetical protein  63.85 
 
 		 209 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1247  hypothetical protein  63.85 
 
 		 209 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.127148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2222  hypothetical protein  63.85 
 
 		 209 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.32 
 
 		 380 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  40.62 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  42.93 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  42.68 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  43.25 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  43 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  43 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  43 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  43 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  43 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  43 
 
 		 436 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  42.61 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  43.96 
 
 		 384 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0293  outer membrane porin OpcP  63.38 
 
 		 209 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  43.13 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  41.69 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  43.92 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  43.13 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  42.75 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1660  hypothetical protein  62.44 
 
 		 209 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  41.31 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>