More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0061 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 379 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  47.21 
 
 		 394 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  47.21 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  47.21 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  47.21 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0385  outer membrane protein (porin)  43.49 
 
 		 370 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  43.23 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.06 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  43.23 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.81 
 
 		 385 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3103  porin  43.49 
 
 		 370 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5264  porin  43.49 
 
 		 370 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5009  porin  43.23 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.22 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.64 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.64 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2630  OmpC family outer membrane porin  43.48 
 
 		 390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4523  OmpC family outer membrane porin  43.48 
 
 		 390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000520547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.64 
 
 		 383 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.14 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  41.6 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6220  porin  44.24 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.811585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  44.94 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.5 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.5 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.5 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.5 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.5 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.5 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.5 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6622  porin  44.24 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  41.69 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6389  porin  44.24 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108998  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  44.05 
 
 		 383 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  44.05 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.39 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  44.36 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  43.22 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  43.22 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  42.25 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  41.71 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.37 
 
 		 374 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.14 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  44.3 
 
 		 383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.22 
 
 		 375 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.22 
 
 		 375 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  42.97 
 
 		 389 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  41.05 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  41.21 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  43.65 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.22 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  41.52 
 
 		 386 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  41.52 
 
 		 386 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  41.52 
 
 		 386 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  41.52 
 
 		 386 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  41.52 
 
 		 386 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.27 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  42.42 
 
 		 387 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  43.16 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  43.14 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  43.16 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  44.68 
 
 		 384 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  44.68 
 
 		 384 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  44.68 
 
 		 384 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  41.93 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  45.13 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  43.05 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44.68 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44.68 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  41.27 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.94 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  42.59 
 
 		 382 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  42.63 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  40.2 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  44.42 
 
 		 384 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  43.61 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  42.46 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  40.54 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  41.1 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  40.6 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  41.28 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 		 392 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.11 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  41.54 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  45.09 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  41.21 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  41.54 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  40.25 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  41.54 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  46.01 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  41.21 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  41.21 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  44.19 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  41.29 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.16 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  41.29 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  44.72 
 
 		 430 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  44.72 
 
 		 430 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  44.72 
 
 		 430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  44.83 
 
 		 380 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>