More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4101 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4101  porin  100 
 
 		 372 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  60.94 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  60.68 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  58.01 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  58.01 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  58.01 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  58.01 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  57.7 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  57.7 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  58.47 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  57.7 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  57.7 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  58.29 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  58.29 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  58.29 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  57.64 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  57.37 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  58.64 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  58.9 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  52.36 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  48.34 
 
 		 383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  48.48 
 
 		 383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  47.68 
 
 		 383 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  48.21 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  47.96 
 
 		 379 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  47.96 
 
 		 379 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  47.96 
 
 		 379 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  47.96 
 
 		 379 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  47.96 
 
 		 379 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  47.19 
 
 		 381 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  47.22 
 
 		 383 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  48.21 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  46.53 
 
 		 381 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  44.3 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  46.46 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  47.47 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  47.19 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.31 
 
 		 381 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  46.5 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  45.52 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  48.09 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  46.43 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  47.84 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  47.42 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  47.22 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  46.17 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  46.02 
 
 		 380 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  45.15 
 
 		 380 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  45.71 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  48.23 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  45.32 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  46.72 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  46.72 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  48.23 
 
 		 380 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.1 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  46.46 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.1 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  46.46 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  46.46 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  45.2 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  45.2 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  45.41 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  46.91 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  45.2 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  41.94 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  46.21 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  44.58 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  44.58 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  44.58 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  44.58 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  44.58 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  44.58 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  44.58 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  45.64 
 
 		 391 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.59 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.85 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  45.71 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  44.58 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  46.91 
 
 		 375 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  46.91 
 
 		 375 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  45.41 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  42.68 
 
 		 394 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.58 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.78 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  45.2 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.61 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.53 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.53 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.53 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.53 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.53 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.53 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  46.76 
 
 		 411 aa  272  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  47.58 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  45.73 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.88 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.27 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.62 
 
 		 385 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  41.34 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  43.69 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>