More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4590 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4590  porin  100 
 
 		 372 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  99.73 
 
 		 372 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  84.27 
 
 		 362 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  84.27 
 
 		 362 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  84.27 
 
 		 362 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  85.29 
 
 		 361 aa  567  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  81.48 
 
 		 374 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  80.38 
 
 		 363 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  75.53 
 
 		 374 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  75.53 
 
 		 374 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  75.26 
 
 		 374 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  75.13 
 
 		 376 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  75.13 
 
 		 376 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  75.26 
 
 		 374 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  75.13 
 
 		 376 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  75.13 
 
 		 376 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  66.06 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  65.45 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  58.64 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  51.64 
 
 		 387 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  50.37 
 
 		 383 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  50.12 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.15 
 
 		 379 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  50.9 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  50.9 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  50.9 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  50.38 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  50.64 
 
 		 379 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.01 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  50.51 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  51.89 
 
 		 380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  50 
 
 		 374 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  49.49 
 
 		 384 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  49.49 
 
 		 384 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  51.64 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  49.49 
 
 		 384 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  49.49 
 
 		 384 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  49.49 
 
 		 384 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  49.49 
 
 		 384 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  49.49 
 
 		 384 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  49.49 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  49.23 
 
 		 414 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  51.01 
 
 		 384 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.87 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.51 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  49.62 
 
 		 379 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  50.38 
 
 		 384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.23 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  49.36 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  49.11 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  49.13 
 
 		 391 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  48.6 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  50.94 
 
 		 383 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.69 
 
 		 384 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  49.36 
 
 		 380 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  48.21 
 
 		 384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  49.11 
 
 		 380 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.67 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.67 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.67 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  48.35 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  48.24 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  48.35 
 
 		 379 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.7 
 
 		 383 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  48.18 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  49.32 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  46.55 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.41 
 
 		 384 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  47.18 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  46.15 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  46.04 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  46.04 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  46.04 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  45.78 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  45.78 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  45.78 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  46.84 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  46.67 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  46.84 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  45.52 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  46.72 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  44.71 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  46.58 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  46.17 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  47.16 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  45.76 
 
 		 376 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  46.39 
 
 		 375 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  44.22 
 
 		 392 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  44.85 
 
 		 383 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.4 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  45.15 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  42.75 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  45.62 
 
 		 375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  45.62 
 
 		 375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  43.22 
 
 		 386 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.27 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.27 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  43.24 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  42.79 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  43.7 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>