More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0570 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 366 aa  739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.04 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  44.84 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.27 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  43.88 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.02 
 
 		 385 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.02 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.02 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.77 
 
 		 383 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  43.83 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.22 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.25 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.25 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.25 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.25 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.25 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.25 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  43.54 
 
 		 436 aa  279  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  44.76 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  42.89 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  43.99 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  43.37 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  43.51 
 
 		 381 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  43.37 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  43.37 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  42.37 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  42.37 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  42.11 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.54 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  43.77 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.06 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  43.11 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.6 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  44.05 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.04 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.04 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  42.16 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  42.41 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.23 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.04 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  43.38 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  42.86 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  43.01 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  42.86 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  42.86 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  42.86 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  42.86 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  41.73 
 
 		 394 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  42.86 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  42.86 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.21 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.21 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.21 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  41.96 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  41.64 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  41.96 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  40.71 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  42.34 
 
 		 414 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.19 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  40.41 
 
 		 384 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  42.01 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  43.86 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  43.16 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  42.9 
 
 		 380 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  41.87 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  42.07 
 
 		 389 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  42.07 
 
 		 389 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  43.08 
 
 		 384 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  43.08 
 
 		 384 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  43.08 
 
 		 384 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  43.6 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  41.81 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  41.16 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  41.16 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  41.76 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  43.46 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  42.6 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  43.46 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  43.46 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  42.23 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  43.46 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.46 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  43.46 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  42.29 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  41.71 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  42.47 
 
 		 380 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  41.53 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  40.99 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  40.99 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  42.2 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  42.82 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  42.12 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  40.63 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  41.64 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  40.45 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  41.56 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  40.77 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0385  outer membrane protein (porin)  41.51 
 
 		 370 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  42.56 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  42.67 
 
 		 384 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>