More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6220 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6220  porin  100 
 
 		 397 aa  797    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.811585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6389  porin  99.5 
 
 		 397 aa  795    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108998  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6622  porin  99.5 
 
 		 397 aa  795    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2630  OmpC family outer membrane porin  48.02 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4523  OmpC family outer membrane porin  48.02 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000520547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  43.75 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  44.47 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  43.73 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  43.72 
 
 		 394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  43.72 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  43.72 
 
 		 394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  43.03 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.93 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  41.32 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.79 
 
 		 383 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  42.51 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.97 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.97 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.97 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  41.49 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.97 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.97 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.97 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.97 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  43.14 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  43.14 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  43.14 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.55 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  42.61 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.58 
 
 		 374 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.63 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  42.89 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  41.59 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  42.89 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  42.89 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  41.88 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  41.59 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  41.59 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.39 
 
 		 383 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  40.62 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  41.45 
 
 		 379 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  41.59 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  41.59 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  42.89 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.18 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  41.73 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  40.3 
 
 		 370 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0385  outer membrane protein (porin)  40.45 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  42.82 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  41.65 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  41.54 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5009  porin  40.45 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  42.46 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  42.54 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  41.65 
 
 		 380 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  40.2 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3103  porin  40.45 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5264  porin  40.45 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.79 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  41.41 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  41.79 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  42.49 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  39.05 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  42.29 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  42.29 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  41.79 
 
 		 379 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  40.44 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  40.66 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  40.66 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  40.66 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  39.9 
 
 		 375 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  40.77 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  40.39 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  39.81 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  41.01 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  42.82 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  42.93 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  41.67 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3186  porin  39.53 
 
 		 379 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  39.74 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  40.42 
 
 		 363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  40.14 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  38.22 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  40.4 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  40.15 
 
 		 384 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  39.29 
 
 		 376 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  39.39 
 
 		 384 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  38.89 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  39.42 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  39.42 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  40.29 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  38.69 
 
 		 395 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  40.29 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.76 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  42.49 
 
 		 374 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  40.67 
 
 		 411 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  38.6 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  39.61 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  39.9 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  37.68 
 
 		 383 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>