More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0285 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
367 aa  744    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  74.72 
 
 
358 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  74.66 
 
 
365 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  74.66 
 
 
365 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  74.66 
 
 
365 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  74.66 
 
 
365 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  75 
 
 
358 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  60.56 
 
 
369 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  60.56 
 
 
385 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  56.77 
 
 
372 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  46.06 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.7 
 
 
381 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  45.92 
 
 
381 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  44.92 
 
 
381 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  44.39 
 
 
379 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  44.64 
 
 
379 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  44.64 
 
 
379 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  44.44 
 
 
383 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  46.41 
 
 
375 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  44.64 
 
 
379 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  46.41 
 
 
375 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  44.64 
 
 
379 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  45.38 
 
 
375 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  46.13 
 
 
375 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  44.39 
 
 
379 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  44.19 
 
 
383 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  46.22 
 
 
379 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  46.3 
 
 
380 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  46.3 
 
 
380 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  45.33 
 
 
374 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.73 
 
 
384 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  44.22 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  44.22 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44.22 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  44.22 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44.22 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  43.7 
 
 
384 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  43.3 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  42.56 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  42.82 
 
 
392 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.27 
 
 
385 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.01 
 
 
385 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  42.46 
 
 
375 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  43.96 
 
 
380 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  43.64 
 
 
396 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  41.48 
 
 
390 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  42.44 
 
 
380 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  43.96 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  41.37 
 
 
391 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.03 
 
 
383 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  42.47 
 
 
394 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  43.41 
 
 
380 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  42.53 
 
 
389 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  42.97 
 
 
394 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  42.31 
 
 
380 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  40.97 
 
 
387 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  42.03 
 
 
380 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  42.74 
 
 
385 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  42.31 
 
 
379 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  41.76 
 
 
366 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  41.9 
 
 
383 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  41.01 
 
 
370 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  39.34 
 
 
389 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  42.59 
 
 
379 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.41 
 
 
383 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  41.37 
 
 
411 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.19 
 
 
383 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.19 
 
 
383 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  42.93 
 
 
383 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  42.46 
 
 
384 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  41.81 
 
 
394 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  41.81 
 
 
394 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  41.81 
 
 
394 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  41.19 
 
 
394 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  41.85 
 
 
379 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  41.38 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.51 
 
 
384 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.51 
 
 
384 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.51 
 
 
384 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.51 
 
 
384 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.51 
 
 
384 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  42.86 
 
 
383 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.51 
 
 
384 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.51 
 
 
384 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  42.27 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  42.27 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  42.27 
 
 
436 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  41.54 
 
 
391 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  42.27 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  42.27 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  42.27 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  42.01 
 
 
436 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  41.51 
 
 
414 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  40.11 
 
 
381 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  42.75 
 
 
382 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  41.1 
 
 
386 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  42.01 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  41.27 
 
 
375 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  43.65 
 
 
377 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  41.48 
 
 
383 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>