More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6199 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  93.65 
 
 		 394 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  100 
 
 		 394 aa  778    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  99.75 
 
 		 394 aa  776    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  99.75 
 
 		 394 aa  776    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  47.21 
 
 		 379 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2630  OmpC family outer membrane porin  45.89 
 
 		 390 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4523  OmpC family outer membrane porin  45.89 
 
 		 390 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000520547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.55 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.32 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.15 
 
 		 379 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  45.35 
 
 		 381 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.24 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  43.17 
 
 		 381 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  44.96 
 
 		 380 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  45.21 
 
 		 379 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  43.98 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  44.44 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.36 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  43.58 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  43.69 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  44.79 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  44.79 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  44.17 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  45.81 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.48 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.48 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.48 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  42.48 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  42.48 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  42 
 
 		 379 aa  278  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  41.63 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.79 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  43.37 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  42.62 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  42.23 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  43.34 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.92 
 
 		 375 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  42.13 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  42.13 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  43.41 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  41.9 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.88 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  43.1 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  43.1 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.88 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.88 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.88 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  43.18 
 
 		 375 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.67 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.67 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.62 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  44.56 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  42.58 
 
 		 409 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  42.58 
 
 		 409 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  43.6 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  42.69 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  40.57 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  41.34 
 
 		 370 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3186  porin  44.47 
 
 		 379 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  41.69 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  41.55 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  44.1 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  42.97 
 
 		 471 aa  255  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  39.86 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6622  porin  43.72 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6389  porin  43.72 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108998  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  40 
 
 		 392 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6220  porin  43.72 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.811585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  40.24 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  40.81 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  41.08 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.46 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  39.12 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  41.12 
 
 		 391 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  41.36 
 
 		 391 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  42.75 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  39.9 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  41.81 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  41.71 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  40.24 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  40.66 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  40.66 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  40.66 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  40.66 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  40.66 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  40.66 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  40.66 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.71 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.71 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  43.69 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  39.47 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  40.66 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  39.55 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.4 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  38.9 
 
 		 386 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.15 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  39.32 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  40.25 
 
 		 384 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  40.21 
 
 		 382 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>