More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4307 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  83.84 
 
 		 403 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  82.54 
 
 		 403 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  83.84 
 
 		 403 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  81.34 
 
 		 471 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  96.41 
 
 		 418 aa  804    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  84.09 
 
 		 398 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  100 
 
 		 418 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  78.48 
 
 		 419 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  79.73 
 
 		 407 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  79.73 
 
 		 407 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  79.73 
 
 		 407 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  79.73 
 
 		 407 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  79.47 
 
 		 407 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  79.47 
 
 		 419 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  79.73 
 
 		 407 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.46 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  47.37 
 
 		 409 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  47.37 
 
 		 409 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  45.41 
 
 		 383 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  44.64 
 
 		 383 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  44.78 
 
 		 384 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  45.29 
 
 		 386 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  44.69 
 
 		 386 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  44.85 
 
 		 375 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  42.75 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  44.7 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.85 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  42.11 
 
 		 381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.46 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.01 
 
 		 375 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.01 
 
 		 375 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  42.74 
 
 		 375 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.71 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.71 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.71 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  42.71 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.21 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  42.31 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  42.46 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  42.78 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  42.36 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  45.66 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.77 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  43.04 
 
 		 383 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  43.39 
 
 		 379 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  41.32 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  44.85 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  41.49 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  42.56 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  42.42 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  42.42 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  42.42 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  41.82 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  44.68 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.69 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  42.42 
 
 		 384 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  42.54 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.44 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  42.17 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  42.17 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  42.14 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  41.91 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  41.64 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.58 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.58 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.58 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.58 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  40.39 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.58 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.58 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.58 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  41.36 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  39.95 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40.79 
 
 		 383 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40.79 
 
 		 383 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.41 
 
 		 384 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  42.06 
 
 		 382 aa  256  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  41.58 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  39.9 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  42.71 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  39.9 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  42.3 
 
 		 384 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  42.25 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.29 
 
 		 383 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  41.5 
 
 		 380 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  41.69 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  41.69 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  41.69 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  41.92 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  42.56 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  42.56 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  40.5 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  37.72 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  44.33 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.9 
 
 		 383 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  42.04 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.7 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  41.58 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  41.97 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>