More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3186 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3186  porin  100 
 
 		 379 aa  765    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  48.27 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0385  outer membrane protein (porin)  45.82 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  45.82 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5009  porin  45.01 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5264  porin  44.74 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3103  porin  44.74 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  45.28 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  44.47 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  44.47 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  44.47 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  42.32 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  40.84 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2630  OmpC family outer membrane porin  42.34 
 
 		 390 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4523  OmpC family outer membrane porin  42.34 
 
 		 390 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000520547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  43.57 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  39.75 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  42.94 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  40.05 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.81 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.81 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.81 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  40.69 
 
 		 396 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.56 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.56 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  41 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  42.25 
 
 		 414 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.56 
 
 		 384 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.31 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  42.25 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  42.25 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  42.25 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  42.25 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  42.25 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  42.25 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  42.25 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6622  porin  39.02 
 
 		 397 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6389  porin  39.02 
 
 		 397 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108998  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6220  porin  39.02 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.811585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.1 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  40.99 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.54 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  39.6 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.03 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  37.56 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.03 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.07 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  38.89 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  40.89 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.31 
 
 		 385 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  38.93 
 
 		 409 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  38.93 
 
 		 409 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  41.67 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  37.53 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  39.6 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  39.85 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  39.58 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  39.58 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  40.15 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  39.58 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  38.73 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.87 
 
 		 383 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  38.21 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  41.08 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  41.67 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  40.1 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  41.15 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  39.1 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  41.08 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  37.83 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  39.84 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  42.08 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  39.19 
 
 		 387 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.72 
 
 		 383 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  37.66 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  37.4 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  39.36 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  37.66 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  37.66 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  37.66 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  37.66 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  37.66 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  39.62 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  39.13 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.37 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  36.74 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.44 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  39.35 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  39.15 
 
 		 372 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  38.89 
 
 		 383 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  39.49 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  37.4 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  39.49 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  39.49 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.19 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  40.21 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  39.49 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  39.49 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  38.82 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  38.82 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>