More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1014 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  100 
 
 		 402 aa  798    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  72.77 
 
 		 411 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  75.82 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  64.1 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  54.01 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  51.52 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  51.01 
 
 		 395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  51.39 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  53.48 
 
 		 398 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  50.76 
 
 		 395 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  47.94 
 
 		 399 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  48.21 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  47.89 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  43.66 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  44.53 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  44.94 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  43.86 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  44.94 
 
 		 400 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  44.94 
 
 		 400 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.36 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.36 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.36 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  44.94 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.36 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  42.54 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  43.36 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44.27 
 
 		 421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44.27 
 
 		 421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43.75 
 
 		 397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  43.11 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  44.42 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  44.39 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  43.11 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  45.03 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  44.5 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  43.01 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  43.57 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  44.47 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  44.47 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  42.2 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  42.97 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  42.97 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  42.97 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  42.71 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  43.46 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  43.78 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  42.79 
 
 		 409 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  44.7 
 
 		 405 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  42.36 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  42.11 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  41.16 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  41.16 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  41.16 
 
 		 430 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  40.92 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  40.92 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  40.92 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  40.92 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  41.82 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  41.69 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  41.69 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  41.82 
 
 		 436 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  41.69 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  41.69 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  41.69 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  42.49 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  42.04 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  42.49 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  41.62 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  41.64 
 
 		 390 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  41.22 
 
 		 385 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  41.56 
 
 		 386 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0452  porin  43.85 
 
 		 292 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  40.86 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  39.36 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  41.36 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  41.36 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.89 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  39.73 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.51 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.39 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  41.39 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  39.23 
 
 		 390 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  40.27 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  38.42 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  40.73 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  39.25 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  39.8 
 
 		 386 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  39.8 
 
 		 386 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  39.25 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  40.32 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  40.25 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  39.25 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  40.79 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.39 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.39 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  41.18 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  40.43 
 
 		 430 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  40.43 
 
 		 430 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  40.75 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  40.67 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>