More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6035 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  93.09 
 
 
405 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  100 
 
 
405 aa  803    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  72.35 
 
 
405 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  74.81 
 
 
406 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  67.24 
 
 
406 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  66.42 
 
 
399 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  68.59 
 
 
400 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  68.32 
 
 
400 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  68.59 
 
 
400 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  68.59 
 
 
400 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  66.42 
 
 
399 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  68.06 
 
 
400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  67.18 
 
 
411 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  69.09 
 
 
405 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  69.82 
 
 
409 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  66.17 
 
 
406 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  62.81 
 
 
406 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  62.81 
 
 
406 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  62.81 
 
 
406 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  61.98 
 
 
405 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  63.31 
 
 
404 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  62.79 
 
 
405 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  64.66 
 
 
399 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  59.95 
 
 
405 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  44.69 
 
 
394 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  45.31 
 
 
395 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  45.05 
 
 
395 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  45.31 
 
 
395 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  45.41 
 
 
398 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  45.14 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  43.66 
 
 
394 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  43.64 
 
 
402 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  41.99 
 
 
397 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  41.75 
 
 
397 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  41.99 
 
 
421 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  42.82 
 
 
397 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  41.99 
 
 
421 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  42.05 
 
 
411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  41.99 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  43.64 
 
 
445 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  43.48 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  41.75 
 
 
397 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  42.54 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  42.39 
 
 
399 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  42.39 
 
 
399 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  42.29 
 
 
391 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  42.39 
 
 
399 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  42.39 
 
 
399 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.34 
 
 
389 aa  249  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  42.46 
 
 
393 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  40.64 
 
 
386 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  40.64 
 
 
436 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  40.64 
 
 
386 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  40.64 
 
 
386 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  40.64 
 
 
386 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  40.64 
 
 
386 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  42.53 
 
 
389 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  40.39 
 
 
436 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.79 
 
 
383 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.79 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.79 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  42.08 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  40.39 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  41.79 
 
 
393 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  42.01 
 
 
389 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.35 
 
 
385 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.1 
 
 
385 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  37.68 
 
 
389 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  41.82 
 
 
390 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  42.38 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  39.71 
 
 
430 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  39.71 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  39.46 
 
 
390 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  39.46 
 
 
430 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  39.46 
 
 
430 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  39.46 
 
 
430 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  39.46 
 
 
430 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  40.92 
 
 
390 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  40.66 
 
 
390 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  40.46 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  36.98 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  40 
 
 
404 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  40.83 
 
 
390 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  42.86 
 
 
385 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  42.27 
 
 
385 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  42.27 
 
 
385 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  39.09 
 
 
386 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  41.41 
 
 
390 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  41.41 
 
 
390 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  41.48 
 
 
400 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  42.52 
 
 
385 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  42.52 
 
 
385 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  39.64 
 
 
403 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  42.23 
 
 
385 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  40.87 
 
 
523 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  38.57 
 
 
366 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  38.67 
 
 
366 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  38.57 
 
 
366 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  37.28 
 
 
396 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  40.46 
 
 
386 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>