More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7685 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  95.38 
 
 
390 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  83.12 
 
 
430 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  83.12 
 
 
390 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  83.38 
 
 
430 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  83.38 
 
 
430 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  83.12 
 
 
430 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
390 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  83.38 
 
 
430 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  92.56 
 
 
390 aa  723    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  95.38 
 
 
390 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  95.64 
 
 
390 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  91.79 
 
 
390 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  91.79 
 
 
390 aa  718    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  83.12 
 
 
430 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  59.23 
 
 
387 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  59.31 
 
 
394 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  57.54 
 
 
386 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  56.78 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  56.52 
 
 
386 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  56.52 
 
 
386 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  56.52 
 
 
386 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  56.52 
 
 
386 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  53.83 
 
 
389 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  57.69 
 
 
411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  57.69 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  57.69 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  57.69 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  57.99 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  57.69 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  57.69 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  56.8 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  57.69 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  57.72 
 
 
385 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  57.45 
 
 
385 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  57.65 
 
 
388 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  55.24 
 
 
386 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  56.8 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  56.28 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  57.14 
 
 
523 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  57.99 
 
 
385 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  57.99 
 
 
385 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  57.72 
 
 
385 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  52.53 
 
 
390 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  54.34 
 
 
376 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  54.34 
 
 
376 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  54.08 
 
 
376 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  51.7 
 
 
404 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  49.87 
 
 
386 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  52.45 
 
 
386 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  53.24 
 
 
376 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  49.39 
 
 
399 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  49.39 
 
 
399 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  49.39 
 
 
399 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  49.39 
 
 
399 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  49.87 
 
 
399 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  49.62 
 
 
391 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  50.26 
 
 
386 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  49.49 
 
 
386 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  50.95 
 
 
386 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  50.95 
 
 
386 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  49.75 
 
 
389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  50.38 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  49.62 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  49.62 
 
 
386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  49.62 
 
 
386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  49.62 
 
 
386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  49.62 
 
 
386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  48.59 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  49.62 
 
 
386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  48.59 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  46.82 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  46 
 
 
421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  46 
 
 
421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  47.07 
 
 
397 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  49.36 
 
 
386 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  45.8 
 
 
397 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  46.95 
 
 
445 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  45.8 
 
 
397 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  47.21 
 
 
397 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  48.59 
 
 
383 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  49.36 
 
 
383 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  49.1 
 
 
383 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  49.1 
 
 
383 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  48.29 
 
 
389 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  47.37 
 
 
391 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  47.77 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  48.98 
 
 
402 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  43.39 
 
 
389 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  45.32 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  42.93 
 
 
394 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  43.08 
 
 
395 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  44.58 
 
 
383 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  43.08 
 
 
395 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  43.18 
 
 
395 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  44.36 
 
 
386 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  43.44 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  43.84 
 
 
398 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0452  porin  48.46 
 
 
292 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  43.56 
 
 
398 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  42.75 
 
 
388 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>