More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1795 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 399 aa  787    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  92.23 
 
 		 399 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  74.93 
 
 		 406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  70.6 
 
 		 405 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  71.18 
 
 		 406 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  73.56 
 
 		 400 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  71.64 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  73.56 
 
 		 400 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  73.56 
 
 		 400 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  73.3 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  71.2 
 
 		 405 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  71.61 
 
 		 406 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  69.87 
 
 		 405 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  67.98 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  67.44 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  67.89 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  64 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  70.08 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  70.08 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  68.65 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  65.44 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  65.44 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  65.44 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  66.32 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  49.49 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  49.49 
 
 		 395 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  49.24 
 
 		 395 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  50 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  50.39 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  50.39 
 
 		 398 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  48.64 
 
 		 394 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  48.59 
 
 		 411 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  47.94 
 
 		 402 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  48.84 
 
 		 394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.14 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  42.4 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  42.65 
 
 		 397 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  42.65 
 
 		 421 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  42.65 
 
 		 421 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  41.91 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  41.91 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  42.3 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  42.3 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  42.3 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  42.3 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  42.21 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  42.16 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  41.58 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  41.58 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  41.58 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  41.58 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  41.58 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  41.58 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.8 
 
 		 436 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.91 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  41.34 
 
 		 386 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  42.64 
 
 		 430 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  42.64 
 
 		 430 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  42.64 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  42.39 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  43.38 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  42.39 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  42.39 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  42.39 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.33 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.83 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.83 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  41.49 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  41.23 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  41.65 
 
 		 393 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  42.49 
 
 		 385 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  41.62 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  42.19 
 
 		 386 aa  225  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  41.84 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  41.84 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.49 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  41.71 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.31 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.25 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  42.26 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  42.26 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  42.19 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  38.61 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  41.99 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  39.55 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  40.44 
 
 		 387 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  40.42 
 
 		 411 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  40.42 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  40.42 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  40.42 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  40.21 
 
 		 389 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  40.42 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  40.42 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  41.1 
 
 		 523 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  40.42 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  39.8 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  39.8 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  40.89 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  39.85 
 
 		 376 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>