More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7566 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 405 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  93.09 
 
 		 405 aa  739    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  71.36 
 
 		 405 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  74.31 
 
 		 406 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  68.91 
 
 		 406 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  69.37 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  69.11 
 
 		 400 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  69.37 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  69.37 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  65.84 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  68.85 
 
 		 400 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  66.15 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  64.84 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  68.05 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  65 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  69.03 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  63.26 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  63.26 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  63.26 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  62.53 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  64.08 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  63.31 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  65.45 
 
 		 399 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  60.99 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  44.2 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  45.31 
 
 		 395 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  45.05 
 
 		 395 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  44.79 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  45.67 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  45.41 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  44.88 
 
 		 394 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  44.68 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  42.21 
 
 		 411 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  42.23 
 
 		 397 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  41.99 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  42.23 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  42.23 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  43.58 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  41.99 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  43.04 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  41.85 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.23 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  42.29 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  42.54 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  39.85 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  42.05 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  42.05 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.55 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.55 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.55 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.55 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.55 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.55 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.55 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  41.39 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.3 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  40.05 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.8 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.8 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.35 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  40.87 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  36.5 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.21 
 
 		 385 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  38.96 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  37.01 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  40.26 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  40.51 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  38.73 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  38.32 
 
 		 366 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  40 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  39.25 
 
 		 404 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  40.92 
 
 		 403 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  41.48 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  40.78 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  37.59 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  38.24 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  37.59 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  38.24 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  38.24 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  38.24 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  36.04 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  37.7 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  41.69 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  37.7 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  41.64 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  41.64 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  41.4 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  38.66 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  38.41 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  41.35 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  41.4 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  38.27 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  38.9 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  38.04 
 
 		 409 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>