More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1122 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  100 
 
 
400 aa  792    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  99.75 
 
 
400 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  99.75 
 
 
400 aa  791    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  100 
 
 
400 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  99.5 
 
 
400 aa  787    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  76.23 
 
 
406 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  76.23 
 
 
406 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  76.23 
 
 
406 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  77.09 
 
 
404 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  75.68 
 
 
405 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  76.41 
 
 
405 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  76.12 
 
 
399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  72.39 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  72.64 
 
 
399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  70.23 
 
 
406 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  66.17 
 
 
405 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  69.29 
 
 
405 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  68.5 
 
 
405 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  66.75 
 
 
406 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  67.49 
 
 
406 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  66.41 
 
 
411 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  68.93 
 
 
405 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  64.68 
 
 
405 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  69.55 
 
 
409 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  46.92 
 
 
395 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  47.86 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  46.15 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  45.9 
 
 
395 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  46.99 
 
 
394 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  47.04 
 
 
398 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  46.79 
 
 
398 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  47.41 
 
 
397 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  47.16 
 
 
421 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  47.16 
 
 
421 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  46.91 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  46.42 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  46.08 
 
 
397 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  46.67 
 
 
397 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  47 
 
 
445 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  44.64 
 
 
402 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  44.28 
 
 
411 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  43.66 
 
 
399 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.66 
 
 
399 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.66 
 
 
399 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.66 
 
 
399 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.66 
 
 
399 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  43.91 
 
 
391 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  43.61 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  38.61 
 
 
436 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  38.37 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  38.56 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  38.56 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  38.56 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  38.56 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  38.56 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  38.31 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.31 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  40.1 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.05 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39 
 
 
383 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  39.56 
 
 
393 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.05 
 
 
385 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  39.28 
 
 
389 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  38.81 
 
 
385 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  38.14 
 
 
389 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.81 
 
 
383 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  39.16 
 
 
386 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  39.16 
 
 
386 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  39.16 
 
 
386 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  41.03 
 
 
430 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  38 
 
 
383 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  38 
 
 
383 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  40.79 
 
 
430 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  40.79 
 
 
430 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  40.54 
 
 
390 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  37.93 
 
 
390 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  40.94 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  39.16 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  40.54 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  40.54 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  39.16 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  40.99 
 
 
523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  40.54 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  40.29 
 
 
390 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  40.05 
 
 
390 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  41.38 
 
 
386 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  39.41 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  39.17 
 
 
395 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  39.66 
 
 
390 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  39.42 
 
 
387 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  39.66 
 
 
390 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  40.8 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  40.93 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  40.8 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  40.21 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  39.31 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  40.5 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  40.55 
 
 
385 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  37.68 
 
 
386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  39.8 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>