More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5801 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  100 
 
 		 411 aa  823    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  72.26 
 
 		 405 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  69.44 
 
 		 406 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  67.48 
 
 		 406 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  65.68 
 
 		 399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  66.15 
 
 		 405 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  67.18 
 
 		 405 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  64.2 
 
 		 399 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  66.49 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  66.49 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  66.49 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  64.89 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  66.24 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  66.24 
 
 		 400 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  65.98 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  63.36 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  67.44 
 
 		 409 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  63.1 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  60.31 
 
 		 406 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  60.31 
 
 		 406 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  60.31 
 
 		 406 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  62.02 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  59.03 
 
 		 404 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  58.51 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  43.35 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  44.33 
 
 		 395 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  45.34 
 
 		 398 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  45.56 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  43.6 
 
 		 395 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  44.82 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  43.35 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  42.79 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  43.32 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  42.46 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  40.72 
 
 		 397 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  40 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  39.76 
 
 		 421 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  39.76 
 
 		 421 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  39.52 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  39.47 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  39.8 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  39.28 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  37.98 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  37.98 
 
 		 399 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  37.98 
 
 		 399 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  37.98 
 
 		 399 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  37.98 
 
 		 399 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  38.31 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.97 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  37.97 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  37.97 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  37.97 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  37.97 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  37.97 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  37.97 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  37.47 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  37.72 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  37.47 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  37.99 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.75 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  38.54 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  38.94 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  37.97 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  38.02 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  36.14 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  37.22 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  37.22 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  37.72 
 
 		 389 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  37.62 
 
 		 383 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  39.19 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  39.9 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  39.02 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  39.02 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  39.02 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  37.98 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  39.02 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  39.02 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  38.72 
 
 		 523 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  38.93 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  39.02 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  38.24 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  38.24 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  39.02 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  38.24 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  38.24 
 
 		 430 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  35.59 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  37.41 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  37.41 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  39.77 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  38.21 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  38.21 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  35.27 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  37.61 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  37.61 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  34.89 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  37.95 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  36.45 
 
 		 386 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  35.27 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>