More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5740 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  100 
 
 		 403 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  62.44 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  55.1 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  56.09 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  56.09 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  54.61 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  56.09 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  59.18 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  56.09 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  56.09 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  59.44 
 
 		 385 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  57.47 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  55.84 
 
 		 386 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  56.54 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  55.7 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  57.8 
 
 		 383 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  56.69 
 
 		 389 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  57.8 
 
 		 383 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  57.8 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  55.05 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  56.27 
 
 		 383 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  52.7 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  54.87 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  55.1 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  51.76 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  51.16 
 
 		 400 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  51.16 
 
 		 400 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  48.51 
 
 		 409 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  46.92 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  49.11 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  50.72 
 
 		 352 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  47.18 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  45.25 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  47.86 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  47.17 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  49.09 
 
 		 389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  44.96 
 
 		 386 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  44.78 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  42.61 
 
 		 393 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  47.24 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44.39 
 
 		 421 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44.39 
 
 		 421 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  42.31 
 
 		 408 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  44.15 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.15 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.15 
 
 		 397 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  45.26 
 
 		 397 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  43.44 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  45.19 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  45.57 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  45.41 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  44.92 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  48.44 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  48.44 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  48.44 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  48.44 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  48.44 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  46.39 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  48.44 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  48.44 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  43.14 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  48.16 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  48.44 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  44.3 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.58 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  42.41 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  43.73 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  45.19 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  47.11 
 
 		 384 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  47.11 
 
 		 384 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  47.11 
 
 		 384 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.49 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.49 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.49 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.49 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  44.95 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  45.15 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  43.65 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  47.37 
 
 		 384 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  43.65 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  43.18 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  43.25 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  43.65 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  43.65 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  43.99 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  42.49 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  44.65 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  43.32 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  44.7 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  43.5 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  42.64 
 
 		 386 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.58 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  42.75 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  43.97 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  46.32 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  42.69 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  42.69 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  44.3 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  44.56 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  44.3 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>