More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1082 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1082  porin  100 
 
 		 405 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  78.82 
 
 		 406 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  86.09 
 
 		 409 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  71.18 
 
 		 405 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  73.58 
 
 		 406 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  71.92 
 
 		 406 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  69.17 
 
 		 399 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  67.42 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  68.77 
 
 		 405 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  67.72 
 
 		 405 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  66.91 
 
 		 400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  66.67 
 
 		 400 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  66.67 
 
 		 400 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  66.42 
 
 		 400 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  65.89 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  66.17 
 
 		 400 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  65.19 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  61.8 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  61.8 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  61.8 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  61.8 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  60.58 
 
 		 405 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  60.58 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  62.32 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  43.84 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  43.63 
 
 		 395 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  43.38 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  43.7 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  44.44 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  43.87 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  43.53 
 
 		 394 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  44.72 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  41.56 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  41.56 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  41.56 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  41.46 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  41.22 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  40.98 
 
 		 397 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  42.34 
 
 		 445 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  39.71 
 
 		 397 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  41.46 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  42.23 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  36.78 
 
 		 399 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.47 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.47 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.47 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.47 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  36.52 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  40.26 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.15 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  38.82 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  36.84 
 
 		 436 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  36.84 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  36.84 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  36.84 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  36.84 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  36.84 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  36.59 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  40.36 
 
 		 523 aa  212  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  35.66 
 
 		 389 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  36.59 
 
 		 386 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.1 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  37.75 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.69 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  38.1 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  38.1 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  38.1 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  38.1 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  38.1 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  38.1 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  38.1 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  37.06 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  37.63 
 
 		 389 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  36.82 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  38.6 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  38.6 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  37.24 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  37.92 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  38.22 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  37.92 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  37.92 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  37.78 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  38.35 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  36.22 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  38.64 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  36.21 
 
 		 390 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  37.15 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  36.03 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  37.56 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  37.25 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  37.25 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  37.25 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  35.43 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  35.43 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  39.08 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  37.01 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  37.01 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  36.27 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  36.02 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  37.01 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>