More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0404 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3463  porin  94.71 
 
 		 445 aa  729    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 397 aa  791    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  96.22 
 
 		 421 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  78.34 
 
 		 397 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  93.95 
 
 		 397 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  96.22 
 
 		 421 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  95.72 
 
 		 397 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  94.71 
 
 		 397 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  49.75 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  49.75 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  49.75 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  49.75 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  49.75 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  50.26 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.89 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  47.45 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  47.45 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  47.45 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  47.58 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  46.68 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  44.76 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  46.12 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  46.12 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.75 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  44.69 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  46.82 
 
 		 390 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  48.01 
 
 		 390 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  48.01 
 
 		 390 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  45.57 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  46.3 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  46.3 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  46.3 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  46.3 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.52 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.52 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  47.26 
 
 		 400 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.49 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.49 
 
 		 385 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  47.26 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  47.26 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.52 
 
 		 383 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  47.48 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.63 
 
 		 389 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  45.45 
 
 		 393 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  46.03 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  46.03 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  47.26 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  46.95 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  46.03 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  46.68 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  44.79 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  46.7 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  46.7 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  46.95 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  46.45 
 
 		 390 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  46.45 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  46.45 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  46.45 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  46.74 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.36 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  46.84 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.7 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.54 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  44.53 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  45.5 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  44.9 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  44.9 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  44.04 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  42.64 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0452  porin  49.16 
 
 		 292 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  44.05 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  44.59 
 
 		 523 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  44.13 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  44.02 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  44.02 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  44.02 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  43.78 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  44.3 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  44.94 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  44.03 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  45.62 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  45.62 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  44.25 
 
 		 404 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  45.36 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.79 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  44.56 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  43.7 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  42.51 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  43.32 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  43.04 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  41.19 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1232  OmpC family outer membrane porin  43.51 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  42.51 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  42.64 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>