More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3564 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4209  porin  94.13 
 
 		 395 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  100 
 
 		 398 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  94.39 
 
 		 395 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  92.35 
 
 		 395 aa  725    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  93.62 
 
 		 394 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  98.74 
 
 		 398 aa  776    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  57.07 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  53.03 
 
 		 411 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  52.27 
 
 		 402 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  52.41 
 
 		 394 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  50.76 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  50.25 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  47.25 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  46.63 
 
 		 406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  47 
 
 		 406 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  49.44 
 
 		 399 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  47.04 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  47.8 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  46.79 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  46.79 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  47.53 
 
 		 405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  46.79 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  47.48 
 
 		 405 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  46.27 
 
 		 400 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  47.25 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  47.53 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  47.53 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  47.53 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  45.14 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  45.41 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  44.82 
 
 		 411 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  45.11 
 
 		 409 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  45.31 
 
 		 405 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  42.47 
 
 		 406 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  46.46 
 
 		 430 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  45.83 
 
 		 430 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  45.83 
 
 		 430 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  45.57 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  46.74 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  45.57 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  45.57 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  45.69 
 
 		 390 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  45.83 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  44.84 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  41.5 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  45.51 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  41.9 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  41.25 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  41.25 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  44.32 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  44.13 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  44.6 
 
 		 394 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  44.17 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  44.48 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  44.31 
 
 		 385 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  44.17 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  44.48 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  40.26 
 
 		 445 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  44.48 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  44.17 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  44.17 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.35 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.35 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.35 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.35 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  44.2 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  44.19 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  44.19 
 
 		 386 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  44.19 
 
 		 386 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  40.35 
 
 		 399 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  43.56 
 
 		 390 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  44.61 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  44.54 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  41.64 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  43.89 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  44.26 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  44.26 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  39.85 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  40.25 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  42.57 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.03 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  42.35 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  42.57 
 
 		 386 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  42.09 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  42.74 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  43.88 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  42.74 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  43.14 
 
 		 390 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  40.56 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  42.24 
 
 		 404 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  42.74 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  43.02 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  40.31 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  40.31 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  40.31 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  40.31 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  40.31 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  40.31 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.66 
 
 		 389 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  40.05 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>