More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2189 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  100 
 
 		 366 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  95.36 
 
 		 366 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  100 
 
 		 366 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.77 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.51 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.27 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.01 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.01 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.23 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.27 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.06 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.06 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.81 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.81 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.81 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.81 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.81 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.81 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  44.09 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.43 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.3 
 
 		 389 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  42.93 
 
 		 386 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.22 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.18 
 
 		 389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  43.6 
 
 		 387 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  44.56 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  44.56 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  44.56 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  42.68 
 
 		 383 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  44.56 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  44.56 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  44.56 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  44.56 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  42.93 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  44.05 
 
 		 414 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  42.46 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.78 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.78 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  42.78 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  43.2 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  40.36 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  44.77 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.52 
 
 		 375 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  43.43 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  43.43 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  43.43 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  41.3 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  43.08 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  43.29 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  43.29 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.16 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  42.86 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  43.32 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  41.94 
 
 		 389 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  41.99 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  45.04 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  42.03 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  39.95 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  42.19 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  42.16 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  43.01 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  41.94 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  39.85 
 
 		 396 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  41.95 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  42.64 
 
 		 381 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.69 
 
 		 383 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  43.7 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  39.43 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.34 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  40.77 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  43.43 
 
 		 384 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  41.69 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  42.67 
 
 		 402 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  42.23 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  43.24 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  40.68 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  41.09 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  40.93 
 
 		 377 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  41.24 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  40.7 
 
 		 386 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  40 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  41.55 
 
 		 379 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  42.93 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  42.09 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.69 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.69 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.69 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.69 
 
 		 384 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.69 
 
 		 384 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  40.83 
 
 		 395 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  41.48 
 
 		 379 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.18 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  40.41 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  41.62 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  39.09 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  39.34 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  39.54 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  41.62 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.43 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  39.34 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>