More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0768 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  93.13 
 
 
393 aa  710    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 
393 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  72.04 
 
 
390 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  74.07 
 
 
404 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  67.92 
 
 
385 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  67.92 
 
 
385 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  67.74 
 
 
385 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  65.76 
 
 
411 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  65.76 
 
 
384 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  65.76 
 
 
430 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  65.76 
 
 
430 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  65.76 
 
 
384 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  65.76 
 
 
384 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  65.76 
 
 
384 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  61.06 
 
 
387 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  59.8 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  62.77 
 
 
386 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  59.8 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  65.5 
 
 
385 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  64.17 
 
 
523 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  65.5 
 
 
385 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  59.8 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  59.7 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  65.23 
 
 
385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  61.71 
 
 
386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  58.69 
 
 
386 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  58.69 
 
 
386 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  61.4 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  60.2 
 
 
386 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  61.99 
 
 
388 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  59.59 
 
 
386 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  58.57 
 
 
386 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  55.19 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  59.57 
 
 
386 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  55.19 
 
 
390 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  60.27 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  56.45 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  60.27 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  56.8 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  55.73 
 
 
430 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  55.73 
 
 
430 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  54.2 
 
 
430 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  55.61 
 
 
390 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  55.91 
 
 
390 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  55.61 
 
 
430 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  55.65 
 
 
390 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  55.65 
 
 
390 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  55.61 
 
 
430 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  55.61 
 
 
430 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  52.42 
 
 
376 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  52.42 
 
 
376 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  52.42 
 
 
376 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  52.16 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  50.51 
 
 
389 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  49.5 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  45.64 
 
 
421 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  45.64 
 
 
421 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  49.25 
 
 
385 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  44.64 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  48.65 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  45.38 
 
 
397 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.87 
 
 
397 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  44.62 
 
 
397 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  44.15 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  44.15 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  44.15 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  44.15 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.89 
 
 
397 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  45.27 
 
 
399 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  44.47 
 
 
445 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  45.01 
 
 
391 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.5 
 
 
383 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.5 
 
 
383 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.5 
 
 
383 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.75 
 
 
383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.86 
 
 
436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.36 
 
 
436 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.36 
 
 
386 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.36 
 
 
386 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.36 
 
 
386 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.36 
 
 
386 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.36 
 
 
386 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  45.11 
 
 
386 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  48 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  44.69 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  46.21 
 
 
389 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.51 
 
 
389 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  45.17 
 
 
395 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  45.15 
 
 
414 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  46.58 
 
 
403 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  47.09 
 
 
402 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6447  porin  44.42 
 
 
366 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  44.05 
 
 
381 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>