More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6101 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  100 
 
 		 406 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  74.88 
 
 		 405 aa  624  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  74.06 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  73.05 
 
 		 399 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  70.52 
 
 		 406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  72.02 
 
 		 405 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  71.39 
 
 		 411 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  73.3 
 
 		 409 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  67.24 
 
 		 405 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  66.75 
 
 		 405 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  69.12 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  70.42 
 
 		 399 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  68.93 
 
 		 400 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  68.93 
 
 		 400 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  68.93 
 
 		 400 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  68.67 
 
 		 400 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  68.67 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  66.75 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  65.11 
 
 		 406 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  64.86 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  65.11 
 
 		 406 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  66.24 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  65.11 
 
 		 406 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  65.27 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  45.34 
 
 		 395 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  45.77 
 
 		 394 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  45.09 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  46.1 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  47.12 
 
 		 398 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  46.86 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  45.87 
 
 		 394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  43.5 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  40.95 
 
 		 411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  43.5 
 
 		 394 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  40.59 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  40.1 
 
 		 397 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  40.1 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  40.1 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  40.1 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  39.36 
 
 		 397 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  40.34 
 
 		 397 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  40.78 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  38.39 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  38.31 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  38.31 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  38.31 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  38.31 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  38.18 
 
 		 391 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.27 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  37.44 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  37.19 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  37.72 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  37.72 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  37.72 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  37.72 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  37.72 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  37.47 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  38.73 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  38.73 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  39.23 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  38.73 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  38.73 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  39.12 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  37.47 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  38.57 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  38.14 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  37.44 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  38.57 
 
 		 390 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  39.12 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  39.07 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  38.72 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  36.52 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  36.27 
 
 		 385 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  36.97 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  36.97 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  40.52 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  37.13 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  36.27 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  34.79 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  39.16 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  38.64 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  37.11 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  38.64 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  36.65 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  38.8 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  37.34 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  37.34 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  37.34 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  37.34 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  38.17 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  37.91 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  37.34 
 
 		 384 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  37.37 
 
 		 523 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  37.34 
 
 		 430 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  37.34 
 
 		 430 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  37.11 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  39.22 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>