More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6531 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  100 
 
 		 395 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  64.23 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  64.23 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  64.23 
 
 		 436 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  64.23 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  64.23 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  67.55 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  64.23 
 
 		 436 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  67.82 
 
 		 389 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  64.23 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  63.98 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  64.76 
 
 		 389 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  63.84 
 
 		 385 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  63.59 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  62.56 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  62.06 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  62 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  62.06 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  62.5 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  56.54 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  55.56 
 
 		 391 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  53.08 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  53.96 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  53.64 
 
 		 400 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  52.91 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  51.21 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  54.88 
 
 		 403 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  46.78 
 
 		 408 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  46.9 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  45.69 
 
 		 409 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  51.29 
 
 		 352 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  44.5 
 
 		 379 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  48.64 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  47.49 
 
 		 386 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  44.75 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  44.56 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  45.48 
 
 		 409 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  46.44 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  41.77 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  44.47 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  44.96 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  42.33 
 
 		 422 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  46.23 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  44.85 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  45.02 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  45.6 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  43.48 
 
 		 386 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.31 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  45.04 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  45.08 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  45.08 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  44.96 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  43.6 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  44.14 
 
 		 388 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  45.96 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  42.96 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  45.13 
 
 		 414 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.56 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  44.36 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  44.36 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  44.36 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  42.96 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  44.36 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.48 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  44.36 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  44.36 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  42.2 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  44.36 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  42.21 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  42.96 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  45.05 
 
 		 390 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  42.11 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  44 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  42.46 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  42.11 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  42.11 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  42.43 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  44.79 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  42.11 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  42.11 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  43.11 
 
 		 412 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  42.89 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  42.89 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  44.44 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  46.1 
 
 		 382 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  42.93 
 
 		 398 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  43.19 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  41.95 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  43.18 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  43.98 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  44.95 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  43.57 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  44.79 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  44.79 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  44.79 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.91 
 
 		 383 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  43.72 
 
 		 385 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  44.53 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  45.99 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  44.7 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>