More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2684 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2684  porin  100 
 
 		 402 aa  794    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  69.53 
 
 		 389 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  70.02 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  68.8 
 
 		 385 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  70.02 
 
 		 436 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  70.02 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  70.02 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  70.02 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  69.78 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  70.02 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  68.55 
 
 		 385 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  69.78 
 
 		 386 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  71.25 
 
 		 389 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  67.57 
 
 		 383 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  67.81 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  67.81 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  69.53 
 
 		 389 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  65.6 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  64.39 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  61.02 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  61.86 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  57.6 
 
 		 408 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  58.77 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  62.24 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  55.42 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  53.55 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  55.85 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  55.37 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  51.59 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  56.98 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  50.84 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  52.32 
 
 		 391 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  48.77 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  50.61 
 
 		 412 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  49.76 
 
 		 422 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  48.28 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  46.32 
 
 		 393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  47.04 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  46.76 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  44.53 
 
 		 379 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  47.61 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  47.33 
 
 		 410 aa  302  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  44.04 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44.77 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  44.77 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44.77 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.9 
 
 		 397 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  47.46 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  45.85 
 
 		 388 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.9 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  48.57 
 
 		 414 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  45.11 
 
 		 397 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  47.86 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  47.86 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  47.86 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  47.86 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  47.86 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  47.86 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  47.86 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  44.47 
 
 		 378 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  44.69 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  43.32 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.89 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  44.63 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  44.39 
 
 		 383 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  46.34 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  45.65 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  44.25 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  44.5 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  45.69 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  44.25 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  44.47 
 
 		 390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  46.15 
 
 		 385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  48.07 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  44.5 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  44.5 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  47.3 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  45.61 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  48.07 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  48.07 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  48.07 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  43.8 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  45.61 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  45.61 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  42.5 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  47.7 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  47.83 
 
 		 384 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  46.12 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  44.01 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.76 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  44.01 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  48.59 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  47.58 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.62 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  47.09 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  43.52 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  48.21 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  43.07 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  46.99 
 
 		 384 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  47.22 
 
 		 390 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>