More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1030 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 410 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  53.53 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  53.53 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  51.32 
 
 		 408 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  48.21 
 
 		 412 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  48.73 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  47.22 
 
 		 391 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  45.93 
 
 		 400 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  45.69 
 
 		 400 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  51.87 
 
 		 352 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  46.08 
 
 		 393 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.48 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.48 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.52 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.48 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.48 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.48 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  44.72 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.67 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.91 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.48 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  44.77 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  44.36 
 
 		 391 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  45.28 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  46.15 
 
 		 389 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  40.79 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  46.63 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.25 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  46.68 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  43.99 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  45.43 
 
 		 389 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.15 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.15 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.56 
 
 		 383 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  40.87 
 
 		 408 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  42.2 
 
 		 378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  44.08 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  41.69 
 
 		 388 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  42.52 
 
 		 389 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  40.69 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  41.73 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  40.38 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  42.69 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 		 386 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  38.76 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  38.76 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  38.76 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  38.74 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  38.26 
 
 		 397 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  40.95 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  40.28 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  40.28 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  39.95 
 
 		 445 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  38.28 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  37.08 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  38.48 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  37.94 
 
 		 399 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  39.05 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  37.47 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  37.47 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  37.47 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  37.47 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  40.93 
 
 		 386 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  39.46 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0299  OmpC family outer membrane porin  36.74 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.882508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  40.44 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  39.2 
 
 		 386 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  38.66 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  40.7 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  39.47 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  39.2 
 
 		 390 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  37.92 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  40.97 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  40.62 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  41.39 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  38.17 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  39.04 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  39.04 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  39.18 
 
 		 523 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  39 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  38.94 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  39.04 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  39.44 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  38.94 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  39.62 
 
 		 384 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  37.8 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  39.62 
 
 		 384 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  39.62 
 
 		 384 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.94 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  37.8 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  37.14 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  37.65 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  38.5 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2511  OmpC family outer membrane porin  39.54 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751343  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  38.33 
 
 		 384 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  39.08 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  39.38 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  38.22 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.95 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  38.7 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>