More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3533 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 
409 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  81.42 
 
 
409 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  53.17 
 
 
408 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  53.53 
 
 
410 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  52.05 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  48.79 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  45.97 
 
 
400 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  51.42 
 
 
352 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  48.99 
 
 
412 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  47.92 
 
 
400 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  47.68 
 
 
400 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  44.83 
 
 
389 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  46.86 
 
 
389 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.38 
 
 
385 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.14 
 
 
385 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  46.65 
 
 
403 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.06 
 
 
436 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.17 
 
 
436 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.65 
 
 
386 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.65 
 
 
386 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.65 
 
 
386 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.65 
 
 
386 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.65 
 
 
386 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  46.36 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  45.41 
 
 
386 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.87 
 
 
383 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.87 
 
 
383 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  46.6 
 
 
391 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.9 
 
 
383 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  45.13 
 
 
395 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.71 
 
 
389 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.81 
 
 
389 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  41.63 
 
 
422 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  44.08 
 
 
396 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  43.45 
 
 
393 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  41.83 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  42.27 
 
 
391 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  41.56 
 
 
389 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  42.41 
 
 
398 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  39.9 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  41.69 
 
 
386 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  40.49 
 
 
389 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  40.63 
 
 
391 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  40.52 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.28 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.28 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.28 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.28 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  39.86 
 
 
421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  39.86 
 
 
421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  40.19 
 
 
397 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  40.53 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  39.29 
 
 
397 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  40.3 
 
 
445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  39.62 
 
 
397 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  38.89 
 
 
397 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  38.76 
 
 
397 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  39.13 
 
 
378 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  41.53 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  41.53 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  41.53 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  41.53 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  38.2 
 
 
379 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  41.29 
 
 
430 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  41.29 
 
 
430 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  41.29 
 
 
430 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  41.19 
 
 
390 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  40.14 
 
 
387 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  37.76 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  38.93 
 
 
366 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  36.5 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  38.41 
 
 
390 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  41.29 
 
 
390 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  38.37 
 
 
390 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  38.37 
 
 
390 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  41.29 
 
 
390 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  39.52 
 
 
386 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  38.06 
 
 
390 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  38.85 
 
 
471 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  39.43 
 
 
383 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  39.52 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  41.46 
 
 
390 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  38.46 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  39.52 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  41.31 
 
 
390 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  41.16 
 
 
390 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  41.16 
 
 
390 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  39.04 
 
 
386 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  39.04 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  39.9 
 
 
393 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  37.41 
 
 
391 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  39.04 
 
 
386 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  38.44 
 
 
395 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  38.44 
 
 
395 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  38.04 
 
 
403 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  38.81 
 
 
391 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  38.97 
 
 
384 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  38.97 
 
 
411 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  39.14 
 
 
384 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  36.67 
 
 
378 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>