More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2171 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  100 
 
 		 400 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  66.5 
 
 		 400 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  66 
 
 		 400 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  59.06 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  56.34 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  57.28 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  56.34 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  56.34 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  56.34 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  56.34 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  56.34 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  56.34 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  56.97 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  56.54 
 
 		 383 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  56.1 
 
 		 386 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  57.28 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  57.28 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  56.54 
 
 		 385 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  56.3 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  58.77 
 
 		 402 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  52.49 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  53.06 
 
 		 408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  55.42 
 
 		 389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  55.94 
 
 		 389 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  53.96 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  55.94 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  55.38 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  53.62 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  45.48 
 
 		 409 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  49.63 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  46.02 
 
 		 396 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  45.97 
 
 		 409 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  44.74 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  45.79 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  46.45 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  44.96 
 
 		 388 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  43.28 
 
 		 386 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  44.14 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  45.77 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  46.1 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  46.5 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  44.64 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  45.02 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  44.07 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  44.77 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  42.41 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.03 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.03 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.03 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.03 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.9 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43.28 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  43.97 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  42.51 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  42.51 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  43.17 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  42.79 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  42.03 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  42.52 
 
 		 380 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  44.15 
 
 		 414 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  44.15 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  44.15 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  44.15 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  44.15 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  44.15 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  44.15 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  44.15 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  43.01 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  40.24 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  41.69 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  42.75 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  43.51 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  42.62 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  41.95 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  40.91 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  42.14 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  43.65 
 
 		 390 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  42.12 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  42.12 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  42.12 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  42.63 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  40.98 
 
 		 386 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  42.63 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.8 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  41.28 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  42.37 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.4 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  41.02 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.16 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  42.75 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  41.03 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  41.02 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  44.04 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  42.49 
 
 		 385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  41.02 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  40.44 
 
 		 383 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  41.25 
 
 		 523 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  39.86 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  40.58 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  40.58 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>