More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0272 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 388 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  48.14 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  45.78 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  46.19 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  44.96 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  46.31 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  46.31 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.95 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.95 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.95 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.95 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.95 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.95 
 
 		 436 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.95 
 
 		 436 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  46.68 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.7 
 
 		 386 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  45.89 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  46.92 
 
 		 402 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.71 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.45 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  49.56 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.72 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.45 
 
 		 383 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.45 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.45 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.7 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  39.95 
 
 		 409 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  45.06 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  44.14 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  43.29 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  40.41 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  45.07 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  39.86 
 
 		 422 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  41.71 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  40.53 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  40.16 
 
 		 393 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  39.23 
 
 		 408 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  41.88 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  41.96 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  41.96 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  41.71 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  40.05 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  41.15 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  39.14 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  41.4 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  41.4 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  39.01 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  40.8 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  38.36 
 
 		 386 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  40.79 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  40.37 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  42.18 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  42.18 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  37.31 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  41.91 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  36.83 
 
 		 379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  38.69 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  40.2 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  39.42 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  37.07 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  36.32 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  37.47 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  37.28 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.75 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.5 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  40.47 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  39.6 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  39.35 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  39.35 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  39.35 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  39.95 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  39.95 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  39.1 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  39.95 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  39.95 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  40 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  38.86 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  39.79 
 
 		 523 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  38.21 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  38.21 
 
 		 387 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  36.91 
 
 		 389 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  38.85 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  37.9 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.87 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  38.83 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  38.48 
 
 		 394 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  40.1 
 
 		 414 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  37.76 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  37.76 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  38.1 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  36.7 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  36.36 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  37.25 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  39.58 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  39.58 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  39.58 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  39.51 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  39.58 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>