More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0106 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 398 aa  777    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  48.25 
 
 		 391 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  51.72 
 
 		 385 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  51.22 
 
 		 389 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  51.48 
 
 		 385 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  50.99 
 
 		 383 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  50.99 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  50.99 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  50.49 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  48.13 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  46.81 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  46.65 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  46.81 
 
 		 386 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  46.81 
 
 		 386 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  46.81 
 
 		 386 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  46.81 
 
 		 386 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  46.81 
 
 		 386 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  46.57 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  46.57 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  43.25 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  45.16 
 
 		 393 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  46.13 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  44.07 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  46.25 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.58 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  44.39 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  42.41 
 
 		 409 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  43.41 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  41.85 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  40.72 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  42.93 
 
 		 395 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  41.61 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.61 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  42.86 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  39.33 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  40.84 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.19 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.19 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.19 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.19 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  38.64 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  39.64 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  40.05 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  40.73 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  44.3 
 
 		 410 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  40.49 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  40.49 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  42.86 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  36.78 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  42.79 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  42.79 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  42.79 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  42.55 
 
 		 430 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  42.55 
 
 		 430 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  42.55 
 
 		 430 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  39.37 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  42.41 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  42.55 
 
 		 390 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.9 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  40.54 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  42.98 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  39.55 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  41.03 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  39.25 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  41.47 
 
 		 372 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  41.13 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  38.64 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  40.36 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  41.03 
 
 		 380 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  40.05 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  40.05 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  39.55 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  40.29 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  40.5 
 
 		 379 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  37.32 
 
 		 421 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  37.32 
 
 		 421 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  37.8 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  40.44 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  43 
 
 		 390 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  40.98 
 
 		 384 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  40.44 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  37.11 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  37.56 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  38.57 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  39.01 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  39.1 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  37.62 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  40.44 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  42.2 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  39.9 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40.44 
 
 		 381 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.24 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  38.83 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  37.08 
 
 		 397 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  39.35 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  43.08 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  43.08 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  43.08 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  37.17 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>