More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1413 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 379 aa  761    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  51.46 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  51.19 
 
 		 378 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  46.58 
 
 		 378 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  46.49 
 
 		 386 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  47.21 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  45.71 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  47.06 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  47.06 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  47.06 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  47.06 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  47.06 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  47.06 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  46.62 
 
 		 436 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  46.8 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.29 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.04 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.23 
 
 		 383 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  46.21 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  43.94 
 
 		 395 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.98 
 
 		 383 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.98 
 
 		 383 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  44.64 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  45.41 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.39 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  44.53 
 
 		 402 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.88 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.49 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  42.09 
 
 		 408 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  42.14 
 
 		 400 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  41.24 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.65 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  42.59 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  39.9 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.77 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  40.86 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.77 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  39.61 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  40 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  40.65 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 384 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 384 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 384 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  39.65 
 
 		 384 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  39.65 
 
 		 384 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  39.65 
 
 		 384 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 384 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  39.85 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  41.79 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  40.25 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  39.7 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  39.9 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  40.25 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  35.63 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  38.99 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  38.2 
 
 		 409 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  38.6 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  40.48 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  39.65 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  39.65 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  38.07 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  38.73 
 
 		 381 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  40.5 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  38.23 
 
 		 386 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  36.32 
 
 		 422 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  38.48 
 
 		 385 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  38.4 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  38.9 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  38.9 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  40.15 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  38.9 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  37.97 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  37.53 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  37.13 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  39.04 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  37.06 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.9 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  39.4 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  38.56 
 
 		 375 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  38.56 
 
 		 375 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  40.7 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  38.21 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  37.97 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  37.99 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  35.54 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.45 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  37.67 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  37.68 
 
 		 399 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  40.11 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  38.28 
 
 		 409 aa  222  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  39.15 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  37.97 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.98 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.98 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  38.3 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  38.64 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.98 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  37.97 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  37.09 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.98 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>