More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2747 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 
378 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  52.93 
 
 
386 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  46.58 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  46.19 
 
 
389 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  46.43 
 
 
386 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  46.43 
 
 
436 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  46.43 
 
 
386 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  46.43 
 
 
386 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  46.43 
 
 
386 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  46.43 
 
 
386 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.92 
 
 
436 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.64 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.38 
 
 
385 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  46.17 
 
 
386 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.9 
 
 
383 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  44.5 
 
 
389 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.9 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.9 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.13 
 
 
383 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  45.53 
 
 
380 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  43.97 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  44.14 
 
 
400 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  43.5 
 
 
395 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  44.67 
 
 
393 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.55 
 
 
389 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  46.9 
 
 
403 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.62 
 
 
389 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  44.02 
 
 
391 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  43.55 
 
 
378 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  43.11 
 
 
386 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  43.65 
 
 
383 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  43.11 
 
 
386 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  43.91 
 
 
383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  42.86 
 
 
386 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  42.86 
 
 
386 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  42.86 
 
 
386 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  43.64 
 
 
400 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  43.17 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  44.47 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  42.64 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  41.92 
 
 
387 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  42.5 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  43.39 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  42.35 
 
 
386 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  42.24 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  43.83 
 
 
384 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.83 
 
 
384 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  43.83 
 
 
384 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  43.83 
 
 
384 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  43.43 
 
 
381 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  43.58 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  43.58 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  42.24 
 
 
390 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  43.58 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  43.94 
 
 
381 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  44.29 
 
 
385 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  41.71 
 
 
409 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.29 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  41.25 
 
 
389 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  42.59 
 
 
385 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  43.53 
 
 
390 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  42.86 
 
 
386 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.33 
 
 
381 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.04 
 
 
383 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  42.59 
 
 
385 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  41.73 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  41.73 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  42.36 
 
 
381 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  44.86 
 
 
385 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  42.97 
 
 
386 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.6 
 
 
374 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  42.82 
 
 
386 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  43.8 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  43.01 
 
 
394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  42.75 
 
 
379 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  43 
 
 
379 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.75 
 
 
379 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.75 
 
 
379 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.75 
 
 
379 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.9 
 
 
381 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  41.25 
 
 
380 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  39.21 
 
 
386 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  41.52 
 
 
412 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 
379 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  43.73 
 
 
380 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  38.5 
 
 
421 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  38.5 
 
 
421 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  41.84 
 
 
379 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.98 
 
 
380 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  43.73 
 
 
380 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  41.99 
 
 
376 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.75 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.75 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  38.5 
 
 
397 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.75 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.75 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  41.1 
 
 
390 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  41.75 
 
 
414 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.75 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.75 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>