More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5787 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5787  porin  100 
 
 
352 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  87.5 
 
 
408 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  56.98 
 
 
402 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  53.43 
 
 
436 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  51.42 
 
 
409 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  52.86 
 
 
436 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  52.86 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  52.86 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  52.86 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  53.62 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  52.86 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  51.42 
 
 
409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  52.86 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  52.57 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  54.07 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  54.07 
 
 
400 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  53.71 
 
 
393 aa  328  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  51.31 
 
 
412 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  51.86 
 
 
385 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  52.31 
 
 
389 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  52.99 
 
 
391 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  51.86 
 
 
385 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  52.27 
 
 
389 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  52.44 
 
 
383 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  52.44 
 
 
383 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  52.44 
 
 
383 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  51.15 
 
 
389 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  51.29 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  51.01 
 
 
403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  49.86 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  49.86 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  49.42 
 
 
388 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  45.88 
 
 
422 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  51.87 
 
 
410 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  46.84 
 
 
391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  45.35 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  46.02 
 
 
408 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  44.19 
 
 
378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  42.27 
 
 
396 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  42.69 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  43.97 
 
 
389 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  44.67 
 
 
386 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  42.98 
 
 
398 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  43.1 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  41.79 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  40.35 
 
 
378 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  40.8 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  42.54 
 
 
390 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  42.09 
 
 
384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  42.09 
 
 
411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  42.09 
 
 
384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  42.09 
 
 
384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  41.81 
 
 
430 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  41.81 
 
 
430 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  41.81 
 
 
384 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  42.66 
 
 
385 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  41.48 
 
 
385 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  41.19 
 
 
386 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  42.05 
 
 
385 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  42.17 
 
 
523 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  41.48 
 
 
390 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  43.59 
 
 
393 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  40.62 
 
 
404 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  41.31 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  41.31 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  41.31 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  42.78 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  42.78 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  41.24 
 
 
390 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  41.24 
 
 
390 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  43.02 
 
 
381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  41.03 
 
 
384 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  41.16 
 
 
387 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  42.74 
 
 
393 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  40.06 
 
 
394 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  41.13 
 
 
386 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  40.34 
 
 
384 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  40.34 
 
 
384 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  40.34 
 
 
384 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  40.34 
 
 
384 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  40.34 
 
 
384 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  40.74 
 
 
414 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  40.34 
 
 
384 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  40.34 
 
 
384 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  42.06 
 
 
386 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  39.77 
 
 
366 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  42.17 
 
 
386 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  40.57 
 
 
391 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  41.36 
 
 
386 aa  215  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2511  OmpC family outer membrane porin  40.46 
 
 
396 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751343  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  40.57 
 
 
399 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  40.97 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.57 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.57 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  40.97 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.57 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.57 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  40.69 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  41.67 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  41.67 
 
 
386 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>