More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6875 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6875  porin  100 
 
 		 408 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  87.5 
 
 		 352 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  57.6 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  53.17 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  51.71 
 
 		 409 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  53.06 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  52.18 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  51.08 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  51.08 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  51.08 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  51.08 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  51.08 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  53.64 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  51.33 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  51.08 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  50.37 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  50.84 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  49.63 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  51.09 
 
 		 385 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  50.85 
 
 		 385 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  48.4 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  50.96 
 
 		 389 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  52.44 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  51.33 
 
 		 383 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  51.33 
 
 		 383 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  51.33 
 
 		 383 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  49.88 
 
 		 383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  50.72 
 
 		 389 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  49.15 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  45.63 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  46.78 
 
 		 395 aa  326  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  51.32 
 
 		 410 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  45.65 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  46.19 
 
 		 388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  44.31 
 
 		 393 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  44.47 
 
 		 408 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  41.37 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  42.44 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  44.15 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  42.09 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  41.75 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  42.93 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  43.17 
 
 		 378 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  41.56 
 
 		 378 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  40.2 
 
 		 380 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  41.26 
 
 		 386 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  39.33 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  40.52 
 
 		 387 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  40.05 
 
 		 386 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  39.67 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  39.34 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  38.26 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  41.85 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  41.85 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  39 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  41.11 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  38.73 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.2 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.96 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  40.53 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  40.53 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  40.53 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  39.05 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  40.53 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  40.53 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  40.77 
 
 		 414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  40.53 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  39.05 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  40.53 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  39.18 
 
 		 386 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  40 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  40 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  39.63 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  39.66 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  40 
 
 		 411 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  40 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  39.81 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  41.77 
 
 		 393 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  39.81 
 
 		 386 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  39.81 
 
 		 386 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  40 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.78 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  40.49 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  38.7 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40.29 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  39.81 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  40.4 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.66 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  37.47 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  39.23 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  39.11 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  39.77 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  41.23 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  40.91 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  37.23 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  37.23 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  37.23 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  40.09 
 
 		 384 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>