More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0926 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  773    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  53.59 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  46.49 
 
 		 379 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.45 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.66 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.41 
 
 		 385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.18 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.18 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.18 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.18 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.18 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.18 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.18 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.92 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.66 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.9 
 
 		 383 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  45.29 
 
 		 389 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.39 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.39 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  43.28 
 
 		 400 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.55 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  42.74 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  44.47 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  44.64 
 
 		 393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  45.01 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  42.82 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  41.75 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  44.3 
 
 		 391 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  43.9 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  43.67 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  43.03 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  43.03 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  41.27 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  41.06 
 
 		 396 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  41.96 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  40.41 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  42.89 
 
 		 412 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  42.69 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  40.1 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  39.13 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  40.84 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  40.41 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  40.77 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.3 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.81 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  41.37 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.81 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.81 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.81 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.81 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.81 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  36.76 
 
 		 422 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  40.4 
 
 		 383 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  40.15 
 
 		 383 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  37.44 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  39.14 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  40.25 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  40.81 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.64 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40.4 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  39.74 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  39.89 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  41.37 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  41.94 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  38.54 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  41.94 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  39.53 
 
 		 414 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  37.16 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  38.72 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  37.24 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  39.49 
 
 		 410 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  40.61 
 
 		 376 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  39.21 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  39.21 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  39.21 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  39.01 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  39.01 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  39.01 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  39.01 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  39.01 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  39.01 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  39.01 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  39.59 
 
 		 383 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  39.13 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  37.1 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  37.31 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  39.95 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  40.49 
 
 		 385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  40.27 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  36.66 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  36.66 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  39.01 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  39.01 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  39.01 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  39.4 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  39.21 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  42.17 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  39.01 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  39.01 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  35.22 
 
 		 366 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>