More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6212 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  91.52 
 
 		 389 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  100 
 
 		 389 aa  769    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2511  OmpC family outer membrane porin  59.57 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751343  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2512  OmpC family outer membrane porin  60.06 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.127699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  50.63 
 
 		 385 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  50.38 
 
 		 385 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  49.25 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  49.37 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  49.37 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  49.37 
 
 		 386 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  49.37 
 
 		 386 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  49.37 
 
 		 386 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  49.37 
 
 		 386 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  49.37 
 
 		 386 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  49.25 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  49.25 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  49.12 
 
 		 386 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  49.75 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  51 
 
 		 389 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  51 
 
 		 389 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  49.37 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  49.37 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  48.99 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  48.1 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  45.59 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  44.53 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  46.68 
 
 		 391 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0299  OmpC family outer membrane porin  46.23 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.882508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  45.91 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  45.77 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  46.44 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  48.28 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.71 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  48.68 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  44.15 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  44.39 
 
 		 398 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  40.52 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  44.58 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  43.7 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  41.85 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  42.56 
 
 		 386 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  41.56 
 
 		 409 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  41.25 
 
 		 378 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.25 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  40.1 
 
 		 421 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  40.1 
 
 		 421 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  41.79 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  39.61 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  41.91 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.29 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  40.49 
 
 		 397 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  39.13 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  40.49 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  40.74 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  40.39 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  40.49 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40.49 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  40.49 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  41.73 
 
 		 383 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  43.97 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  40.39 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  41.69 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  40.89 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  40.99 
 
 		 445 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  42.82 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.34 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.34 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  39.8 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.34 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.34 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.34 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.48 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.23 
 
 		 384 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  41.85 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  39.01 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  41.6 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  40.61 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.95 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  41.58 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  41.58 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  39.01 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  41.58 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  41.6 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  39.01 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  39.01 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  40.68 
 
 		 384 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  42.08 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  40.34 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  38.42 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  38.67 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  42.45 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  38.42 
 
 		 379 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  38.42 
 
 		 379 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>