More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0071 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 380 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  51.46 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  47.21 
 
 		 378 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  45.71 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  44.64 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  45.7 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  41.16 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  43.12 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  43.67 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  40.2 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.62 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  42.31 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  42.05 
 
 		 385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  43.15 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  41.12 
 
 		 436 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  43.15 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  41.12 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  41.43 
 
 		 386 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  41.43 
 
 		 386 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  41.43 
 
 		 386 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  41.43 
 
 		 386 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  41.43 
 
 		 386 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  42.2 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  42.52 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  41.18 
 
 		 386 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.09 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  42.27 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.75 
 
 		 383 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.24 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  41.49 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.24 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  41.07 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  38.5 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  41.75 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  37.37 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  40.8 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  39.53 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.04 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.04 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.04 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.04 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.04 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.04 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.04 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  37.79 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  41.25 
 
 		 430 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  40.05 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  41.25 
 
 		 430 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  41.25 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  37.22 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  41 
 
 		 390 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  41 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  41 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  41 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  40.52 
 
 		 414 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  40.32 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  39.79 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  36.98 
 
 		 408 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  37.05 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  37.01 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  38.68 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  39.53 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  41.73 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  40.74 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  40.74 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  39.02 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  39.53 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  39.02 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  38.13 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  41.21 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  40.53 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  39.22 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  40.74 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  38.72 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  39.11 
 
 		 375 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  40.48 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  39.11 
 
 		 375 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  39.73 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  39.11 
 
 		 375 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  39.3 
 
 		 385 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  37.01 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  40.42 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  37.97 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  37.97 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  38.75 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  39.46 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.73 
 
 		 375 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  38.24 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  39.73 
 
 		 523 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  39.56 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  39.56 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  39.46 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  39.95 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  37.06 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  39.29 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  38.62 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  38.05 
 
 		 384 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  37.66 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  38.89 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>