More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2131 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  772    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  47.49 
 
 		 389 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  47.45 
 
 		 391 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  46.33 
 
 		 436 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  46.33 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  46.33 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  46.33 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  46.33 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  46.33 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  47.27 
 
 		 436 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  48.21 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.45 
 
 		 385 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.19 
 
 		 385 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  46.08 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  45.33 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.82 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.82 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  46.82 
 
 		 383 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.31 
 
 		 383 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  47.09 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  46.67 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  47.35 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  46.5 
 
 		 400 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  47.69 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  48.54 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  44.85 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  42.27 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  42.16 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  40.91 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.67 
 
 		 400 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  42.56 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  41.26 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  41.54 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  42.9 
 
 		 378 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  42.17 
 
 		 409 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  38.59 
 
 		 422 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  39.66 
 
 		 408 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  40 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  40.85 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  44.67 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  40.97 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  40.1 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  40.1 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  39.95 
 
 		 412 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  38.5 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  41.19 
 
 		 410 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  39.13 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  38.73 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  38.64 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  39.75 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  38.68 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  37.99 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  38.11 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.54 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.54 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.54 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  40.66 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.54 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  38.36 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  38.01 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  38.01 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  38.01 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  38.86 
 
 		 383 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  36.3 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  37.75 
 
 		 397 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  37.5 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  36.48 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  39.58 
 
 		 385 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  39.51 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  39.47 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  39.58 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  38.59 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.21 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  40.48 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  40.48 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  40.48 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  40.48 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  40.48 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  40.48 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  40.48 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  40.48 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  37.31 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  40.48 
 
 		 414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  39.79 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  38.3 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  39.05 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  38.33 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  39.95 
 
 		 386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  38.87 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  39.3 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2511  OmpC family outer membrane porin  37.73 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751343  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  39.26 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  39.26 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  40.26 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  39.26 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  36.79 
 
 		 366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  39.84 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  37.76 
 
 		 376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>