More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1962 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 391 aa  772    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  51.5 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  50.75 
 
 		 436 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  50.75 
 
 		 386 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  50.75 
 
 		 386 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  50.75 
 
 		 386 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  50.75 
 
 		 386 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  50.75 
 
 		 386 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  50.5 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  51.76 
 
 		 385 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  51.51 
 
 		 385 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  50.5 
 
 		 386 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  49.87 
 
 		 393 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  51.52 
 
 		 383 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  52.01 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  48.25 
 
 		 398 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  51.01 
 
 		 383 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  51.01 
 
 		 383 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  52.32 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  49.75 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  49.37 
 
 		 389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  49.63 
 
 		 400 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  46.9 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  49.87 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  47.86 
 
 		 389 aa  315  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  47.45 
 
 		 386 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  46.27 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  47.65 
 
 		 400 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  47.9 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  45.65 
 
 		 408 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  49.6 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  44.09 
 
 		 422 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  44.69 
 
 		 409 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  43.97 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  45.91 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  44.67 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  42.41 
 
 		 408 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  44.31 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  42.47 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  46.84 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  44.25 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.64 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  44.28 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  43.61 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  42.03 
 
 		 409 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  40.86 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  43.7 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  43.7 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  43.7 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  43.7 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  43.89 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  43.7 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  43.7 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  43.7 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  45.2 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  41.96 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.87 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  42.75 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  44.95 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  46.05 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  42.93 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  42.93 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  42.72 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  42.68 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  41.92 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  41.93 
 
 		 388 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  40.29 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  41.71 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  43.3 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.03 
 
 		 379 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.62 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  41.85 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.62 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  41.12 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  42.33 
 
 		 381 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  42.75 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.62 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.62 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  42.18 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  43.78 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  40 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  40.36 
 
 		 378 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  40.29 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  41.36 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  41.36 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  41.36 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  42.28 
 
 		 385 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  40.05 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  41.5 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  39.56 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  42.21 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  43.78 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  42.46 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.21 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.21 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.21 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  43.03 
 
 		 380 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  40.05 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  40.05 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>