More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0072 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  100 
 
 		 385 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1114  OmpC family outer membrane porin  57.94 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0879907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1115  OmpC family outer membrane porin  57.1 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  42.03 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.77 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  42.82 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  42.82 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  42.38 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  42.38 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  42.38 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  42.38 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  42.38 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  42.28 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  41.62 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  42.12 
 
 		 386 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.97 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.97 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.71 
 
 		 383 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.6 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  41.45 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  41.13 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.43 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  42.67 
 
 		 389 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  42.09 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  39.6 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.1 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.1 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.1 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.1 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.1 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  40.6 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  39.8 
 
 		 394 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  40.27 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  41.08 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  41.08 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  41.48 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.9 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  41.21 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  37.93 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  39.34 
 
 		 381 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.85 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  38.79 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  38.78 
 
 		 394 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  38.78 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  38.78 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  39.04 
 
 		 375 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  40.84 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  42.26 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  39.2 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  41.33 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  42.26 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  42.26 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  42.26 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  42.26 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  41.18 
 
 		 395 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  42.26 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  42.26 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  41.33 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  41.11 
 
 		 385 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.1 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  39.35 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  39.25 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  37.85 
 
 		 383 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.44 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  37.95 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  40.96 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4872  porin  38.11 
 
 		 386 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0644122  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.44 
 
 		 383 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  40.86 
 
 		 380 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  39.39 
 
 		 399 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  39.39 
 
 		 399 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  39.39 
 
 		 399 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  39.39 
 
 		 399 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  37.88 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  41.04 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  39.53 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  37.88 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  37.24 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  40.05 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  40.5 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  39.9 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  40.82 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  37.44 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  37.44 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  39.64 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  40.96 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  40.21 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  40.21 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  40.21 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  40.48 
 
 		 384 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  39.22 
 
 		 383 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  40.05 
 
 		 386 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  39.34 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.84 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  39.74 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  39.95 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.23 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  40.78 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  39.15 
 
 		 381 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>