More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4950 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  100 
 
 		 412 aa  825    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  48.16 
 
 		 408 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  50.13 
 
 		 409 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  49.1 
 
 		 409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  51.28 
 
 		 402 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  51.02 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  47.1 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.94 
 
 		 385 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.7 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  46.8 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  47.46 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  44.31 
 
 		 391 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  47.61 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  46.1 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.22 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  48.07 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.43 
 
 		 436 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.97 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.97 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.66 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.66 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.47 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.66 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.66 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.66 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.73 
 
 		 383 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  44.08 
 
 		 422 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.42 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  46.46 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  44.31 
 
 		 391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  45.96 
 
 		 389 aa  289  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  45.27 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  45.27 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  43.29 
 
 		 388 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  41.85 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  42.75 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  42.89 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  42.05 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  43.11 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  39.15 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  39.81 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  39.95 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  40.89 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  40.89 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  40.34 
 
 		 389 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  41.04 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  40.8 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  40.33 
 
 		 397 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  40.09 
 
 		 397 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  39.61 
 
 		 378 aa  239  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  39.81 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  40.45 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  39.08 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  39.08 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  40.05 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  39.08 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  39.08 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  41.03 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  39.08 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  39.08 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  39.08 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  38.37 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  41.55 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  38.72 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  39.95 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  38.72 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  38.72 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  38.72 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  39.95 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  38.72 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40.05 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  39.85 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  39.15 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  39.11 
 
 		 403 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  39.45 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.79 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  38.48 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  38.13 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  38.13 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  37.99 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  38.65 
 
 		 390 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.24 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  40.58 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  40.53 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  41.6 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  36.71 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  36.62 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  37.97 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  38.15 
 
 		 381 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  38.96 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.56 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.56 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  37.07 
 
 		 375 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  39.04 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  39.8 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  39.2 
 
 		 376 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  36.83 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  41.06 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>