More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6063 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6063  porin  100 
 
 		 390 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  93.59 
 
 		 390 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  93.59 
 
 		 390 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  90.77 
 
 		 390 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  92.56 
 
 		 390 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  94.1 
 
 		 390 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  98.21 
 
 		 390 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  81.59 
 
 		 430 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  81.59 
 
 		 430 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  81.59 
 
 		 430 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  81.33 
 
 		 390 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  81.33 
 
 		 430 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  81.33 
 
 		 430 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  81.33 
 
 		 430 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  59.57 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  55.75 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  57.83 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  56.52 
 
 		 386 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  56.52 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  56.52 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  57.65 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  57.69 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  57.69 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  57.69 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  56.27 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  57.69 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  57.69 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  57.69 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  56.27 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  57.69 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  57.45 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  54.94 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  57.45 
 
 		 385 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  57.45 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  54.36 
 
 		 386 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  56.27 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  56.95 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  56.87 
 
 		 523 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  56.01 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  58.54 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  58.54 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  58.27 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  53.33 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  53.33 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  52.02 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  53.08 
 
 		 376 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  51.7 
 
 		 404 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  50.38 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  48.89 
 
 		 399 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  48.89 
 
 		 399 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  48.89 
 
 		 399 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  52.99 
 
 		 386 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  51.89 
 
 		 376 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  48.89 
 
 		 399 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  49.37 
 
 		 399 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  49.12 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  51.57 
 
 		 386 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  51.57 
 
 		 386 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  51.5 
 
 		 386 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  51.5 
 
 		 386 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  46.82 
 
 		 397 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  47.58 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  45.75 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  45.75 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  47.75 
 
 		 389 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  46.06 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  46.95 
 
 		 445 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.36 
 
 		 385 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.36 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  49.62 
 
 		 436 aa  298  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  46.06 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  46.95 
 
 		 397 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  49.12 
 
 		 436 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  49.12 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  49.12 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  49.12 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  49.12 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  49.12 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  48.87 
 
 		 386 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.58 
 
 		 383 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.34 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.09 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.09 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  46.55 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  46.34 
 
 		 389 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  47.11 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  43.64 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  47.96 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  44.04 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  44.04 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  45.07 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  45.05 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  45.48 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  44.58 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  43.6 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  45.21 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  43.26 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  44.12 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  43.78 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>